Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EPDR1Q9UM22 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EPDR1Q9UM22 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPDR1Q9UM22 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPDR1Q9UM22 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPDR1Q9UM22 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPDR1Q9UM22 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPDR1Q9UM22 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPDR1Q9UM22 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EPDR1Q9UM22 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EPDR1Q9UM22 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EPDR1Q9UM22 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EPDR1Q9UM22 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EPDR1Q9UM22 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPDR1Q9UM22 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPDR1Q9UM22 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EPDR1Q9UM22 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPDR1Q9UM22 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EPDR1Q9UM22 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EPDR1Q9UM22 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPDR1Q9UM22 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EPDR1Q9UM22 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EPDR1Q9UM22 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EPDR1Q9UM22 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EPDR1Q9UM22 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPDR1Q9UM22 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPDR1Q9UM22 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPDR1Q9UM22 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EPDR1Q9UM22 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPDR1Q9UM22 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPDR1Q9UM22 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EPDR1Q9UM22 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EPDR1Q9UM22 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EPDR1Q9UM22 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EPDR1Q9UM22 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EPDR1Q9UM22 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EPDR1Q9UM22 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EPDR1Q9UM22 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EPDR1Q9UM22 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EPDR1Q9UM22 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EPDR1Q9UM22 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPDR1Q9UM22 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPDR1Q9UM22 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPDR1Q9UM22 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPDR1Q9UM22 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EPDR1Q9UM22 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EPDR1Q9UM22 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EPDR1Q9UM22 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EPDR1Q9UM22 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EPDR1Q9UM22 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EPDR1Q9UM22 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EPDR1Q9UM22 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EPDR1Q9UM22 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EPDR1Q9UM22 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21■□□□□ 0.95
EPDR1Q9UM22 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EPDR1Q9UM22 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EPDR1Q9UM22 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EPDR1Q9UM22 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EPDR1Q9UM22 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EPDR1Q9UM22 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EPDR1Q9UM22 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EPDR1Q9UM22 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EPDR1Q9UM22 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPDR1Q9UM22 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
EPDR1Q9UM22 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EPDR1Q9UM22 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EPDR1Q9UM22 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EPDR1Q9UM22 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EPDR1Q9UM22 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EPDR1Q9UM22 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EPDR1Q9UM22 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EPDR1Q9UM22 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EPDR1Q9UM22 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EPDR1Q9UM22 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EPDR1Q9UM22 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EPDR1Q9UM22 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EPDR1Q9UM22 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EPDR1Q9UM22 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EPDR1Q9UM22 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EPDR1Q9UM22 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EPDR1Q9UM22 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EPDR1Q9UM22 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EPDR1Q9UM22 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EPDR1Q9UM22 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EPDR1Q9UM22 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EPDR1Q9UM22 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EPDR1Q9UM22 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EPDR1Q9UM22 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EPDR1Q9UM22 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EPDR1Q9UM22 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPDR1Q9UM22 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPDR1Q9UM22 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPDR1Q9UM22 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPDR1Q9UM22 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EPDR1Q9UM22 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EPDR1Q9UM22 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EPDR1Q9UM22 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPDR1Q9UM22 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPDR1Q9UM22 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EPDR1Q9UM22 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms