Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BRPF3Q9ULD4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BRPF3Q9ULD4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
BRPF3Q9ULD4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
BRPF3Q9ULD4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
BRPF3Q9ULD4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
BRPF3Q9ULD4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
BRPF3Q9ULD4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BRPF3Q9ULD4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
BRPF3Q9ULD4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
BRPF3Q9ULD4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
BRPF3Q9ULD4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
BRPF3Q9ULD4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
BRPF3Q9ULD4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BRPF3Q9ULD4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BRPF3Q9ULD4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BRPF3Q9ULD4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
BRPF3Q9ULD4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
BRPF3Q9ULD4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
BRPF3Q9ULD4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
BRPF3Q9ULD4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
BRPF3Q9ULD4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BRPF3Q9ULD4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BRPF3Q9ULD4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BRPF3Q9ULD4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BRPF3Q9ULD4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BRPF3Q9ULD4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BRPF3Q9ULD4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BRPF3Q9ULD4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
BRPF3Q9ULD4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BRPF3Q9ULD4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BRPF3Q9ULD4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
BRPF3Q9ULD4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
BRPF3Q9ULD4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
BRPF3Q9ULD4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
BRPF3Q9ULD4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
BRPF3Q9ULD4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
BRPF3Q9ULD4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
BRPF3Q9ULD4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
BRPF3Q9ULD4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
BRPF3Q9ULD4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
BRPF3Q9ULD4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
BRPF3Q9ULD4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
BRPF3Q9ULD4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
BRPF3Q9ULD4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
BRPF3Q9ULD4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
BRPF3Q9ULD4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
BRPF3Q9ULD4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
BRPF3Q9ULD4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
BRPF3Q9ULD4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
BRPF3Q9ULD4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
BRPF3Q9ULD4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BRPF3Q9ULD4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
BRPF3Q9ULD4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
BRPF3Q9ULD4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
BRPF3Q9ULD4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BRPF3Q9ULD4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BRPF3Q9ULD4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
BRPF3Q9ULD4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BRPF3Q9ULD4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BRPF3Q9ULD4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
BRPF3Q9ULD4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
BRPF3Q9ULD4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
BRPF3Q9ULD4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
BRPF3Q9ULD4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
BRPF3Q9ULD4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
BRPF3Q9ULD4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
BRPF3Q9ULD4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
BRPF3Q9ULD4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
BRPF3Q9ULD4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
BRPF3Q9ULD4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
BRPF3Q9ULD4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
BRPF3Q9ULD4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
BRPF3Q9ULD4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.85
BRPF3Q9ULD4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
BRPF3Q9ULD4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
BRPF3Q9ULD4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
BRPF3Q9ULD4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
BRPF3Q9ULD4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
BRPF3Q9ULD4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
BRPF3Q9ULD4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
BRPF3Q9ULD4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BRPF3Q9ULD4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BRPF3Q9ULD4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BRPF3Q9ULD4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
BRPF3Q9ULD4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
BRPF3Q9ULD4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
BRPF3Q9ULD4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
BRPF3Q9ULD4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
BRPF3Q9ULD4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
BRPF3Q9ULD4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
BRPF3Q9ULD4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
BRPF3Q9ULD4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
BRPF3Q9ULD4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
BRPF3Q9ULD4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
BRPF3Q9ULD4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
BRPF3Q9ULD4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
BRPF3Q9ULD4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BRPF3Q9ULD4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
BRPF3Q9ULD4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms