Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXL4Q9UKA2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXL4Q9UKA2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXL4Q9UKA2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXL4Q9UKA2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXL4Q9UKA2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXL4Q9UKA2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXL4Q9UKA2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXL4Q9UKA2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FBXL4Q9UKA2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXL4Q9UKA2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXL4Q9UKA2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXL4Q9UKA2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXL4Q9UKA2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXL4Q9UKA2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXL4Q9UKA2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXL4Q9UKA2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXL4Q9UKA2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXL4Q9UKA2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXL4Q9UKA2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXL4Q9UKA2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXL4Q9UKA2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXL4Q9UKA2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXL4Q9UKA2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXL4Q9UKA2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXL4Q9UKA2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXL4Q9UKA2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXL4Q9UKA2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXL4Q9UKA2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXL4Q9UKA2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXL4Q9UKA2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXL4Q9UKA2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXL4Q9UKA2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXL4Q9UKA2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXL4Q9UKA2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXL4Q9UKA2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXL4Q9UKA2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXL4Q9UKA2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXL4Q9UKA2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXL4Q9UKA2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXL4Q9UKA2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXL4Q9UKA2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXL4Q9UKA2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXL4Q9UKA2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXL4Q9UKA2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXL4Q9UKA2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXL4Q9UKA2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXL4Q9UKA2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXL4Q9UKA2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXL4Q9UKA2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXL4Q9UKA2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXL4Q9UKA2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXL4Q9UKA2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXL4Q9UKA2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXL4Q9UKA2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXL4Q9UKA2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXL4Q9UKA2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FBXL4Q9UKA2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXL4Q9UKA2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXL4Q9UKA2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXL4Q9UKA2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXL4Q9UKA2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXL4Q9UKA2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXL4Q9UKA2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXL4Q9UKA2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXL4Q9UKA2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXL4Q9UKA2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXL4Q9UKA2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXL4Q9UKA2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXL4Q9UKA2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXL4Q9UKA2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXL4Q9UKA2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXL4Q9UKA2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXL4Q9UKA2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXL4Q9UKA2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXL4Q9UKA2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXL4Q9UKA2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXL4Q9UKA2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXL4Q9UKA2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXL4Q9UKA2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXL4Q9UKA2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXL4Q9UKA2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXL4Q9UKA2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXL4Q9UKA2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXL4Q9UKA2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXL4Q9UKA2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXL4Q9UKA2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXL4Q9UKA2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXL4Q9UKA2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXL4Q9UKA2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXL4Q9UKA2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXL4Q9UKA2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXL4Q9UKA2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXL4Q9UKA2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXL4Q9UKA2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXL4Q9UKA2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXL4Q9UKA2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXL4Q9UKA2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXL4Q9UKA2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXL4Q9UKA2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms