Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FBXL4Q9UKA2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FBXL4Q9UKA2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FBXL4Q9UKA2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
FBXL4Q9UKA2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FBXL4Q9UKA2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
FBXL4Q9UKA2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
FBXL4Q9UKA2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FBXL4Q9UKA2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FBXL4Q9UKA2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FBXL4Q9UKA2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FBXL4Q9UKA2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FBXL4Q9UKA2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FBXL4Q9UKA2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FBXL4Q9UKA2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FBXL4Q9UKA2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FBXL4Q9UKA2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FBXL4Q9UKA2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FBXL4Q9UKA2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FBXL4Q9UKA2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FBXL4Q9UKA2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FBXL4Q9UKA2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FBXL4Q9UKA2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FBXL4Q9UKA2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FBXL4Q9UKA2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FBXL4Q9UKA2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FBXL4Q9UKA2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FBXL4Q9UKA2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FBXL4Q9UKA2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FBXL4Q9UKA2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FBXL4Q9UKA2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FBXL4Q9UKA2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FBXL4Q9UKA2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FBXL4Q9UKA2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FBXL4Q9UKA2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FBXL4Q9UKA2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FBXL4Q9UKA2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXL4Q9UKA2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXL4Q9UKA2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
FBXL4Q9UKA2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXL4Q9UKA2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FBXL4Q9UKA2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FBXL4Q9UKA2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FBXL4Q9UKA2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
FBXL4Q9UKA2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FBXL4Q9UKA2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXL4Q9UKA2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXL4Q9UKA2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FBXL4Q9UKA2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FBXL4Q9UKA2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXL4Q9UKA2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXL4Q9UKA2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FBXL4Q9UKA2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXL4Q9UKA2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXL4Q9UKA2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FBXL4Q9UKA2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FBXL4Q9UKA2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FBXL4Q9UKA2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FBXL4Q9UKA2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FBXL4Q9UKA2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FBXL4Q9UKA2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FBXL4Q9UKA2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FBXL4Q9UKA2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXL4Q9UKA2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FBXL4Q9UKA2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXL4Q9UKA2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXL4Q9UKA2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FBXL4Q9UKA2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FBXL4Q9UKA2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXL4Q9UKA2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FBXL4Q9UKA2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FBXL4Q9UKA2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FBXL4Q9UKA2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FBXL4Q9UKA2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXL4Q9UKA2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FBXL4Q9UKA2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FBXL4Q9UKA2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FBXL4Q9UKA2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FBXL4Q9UKA2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXL4Q9UKA2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXL4Q9UKA2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FBXL4Q9UKA2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FBXL4Q9UKA2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FBXL4Q9UKA2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FBXL4Q9UKA2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FBXL4Q9UKA2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXL4Q9UKA2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXL4Q9UKA2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXL4Q9UKA2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXL4Q9UKA2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FBXL4Q9UKA2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXL4Q9UKA2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FBXL4Q9UKA2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FBXL4Q9UKA2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FBXL4Q9UKA2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FBXL4Q9UKA2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXL4Q9UKA2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXL4Q9UKA2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXL4Q9UKA2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FBXL4Q9UKA2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms