Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCP2D1Q9UJQ7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCP2D1Q9UJQ7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCP2D1Q9UJQ7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCP2D1Q9UJQ7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCP2D1Q9UJQ7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCP2D1Q9UJQ7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCP2D1Q9UJQ7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCP2D1Q9UJQ7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCP2D1Q9UJQ7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SCP2D1Q9UJQ7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCP2D1Q9UJQ7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCP2D1Q9UJQ7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCP2D1Q9UJQ7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCP2D1Q9UJQ7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCP2D1Q9UJQ7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCP2D1Q9UJQ7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCP2D1Q9UJQ7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCP2D1Q9UJQ7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCP2D1Q9UJQ7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCP2D1Q9UJQ7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCP2D1Q9UJQ7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCP2D1Q9UJQ7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCP2D1Q9UJQ7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCP2D1Q9UJQ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCP2D1Q9UJQ7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCP2D1Q9UJQ7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCP2D1Q9UJQ7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCP2D1Q9UJQ7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCP2D1Q9UJQ7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCP2D1Q9UJQ7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCP2D1Q9UJQ7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCP2D1Q9UJQ7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCP2D1Q9UJQ7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCP2D1Q9UJQ7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCP2D1Q9UJQ7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCP2D1Q9UJQ7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCP2D1Q9UJQ7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCP2D1Q9UJQ7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCP2D1Q9UJQ7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCP2D1Q9UJQ7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCP2D1Q9UJQ7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCP2D1Q9UJQ7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCP2D1Q9UJQ7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCP2D1Q9UJQ7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCP2D1Q9UJQ7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCP2D1Q9UJQ7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCP2D1Q9UJQ7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCP2D1Q9UJQ7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCP2D1Q9UJQ7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCP2D1Q9UJQ7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCP2D1Q9UJQ7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCP2D1Q9UJQ7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCP2D1Q9UJQ7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCP2D1Q9UJQ7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCP2D1Q9UJQ7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCP2D1Q9UJQ7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCP2D1Q9UJQ7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCP2D1Q9UJQ7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCP2D1Q9UJQ7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCP2D1Q9UJQ7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCP2D1Q9UJQ7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCP2D1Q9UJQ7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCP2D1Q9UJQ7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCP2D1Q9UJQ7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCP2D1Q9UJQ7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCP2D1Q9UJQ7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCP2D1Q9UJQ7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCP2D1Q9UJQ7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCP2D1Q9UJQ7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCP2D1Q9UJQ7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCP2D1Q9UJQ7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCP2D1Q9UJQ7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCP2D1Q9UJQ7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCP2D1Q9UJQ7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCP2D1Q9UJQ7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCP2D1Q9UJQ7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCP2D1Q9UJQ7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCP2D1Q9UJQ7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCP2D1Q9UJQ7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCP2D1Q9UJQ7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCP2D1Q9UJQ7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCP2D1Q9UJQ7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCP2D1Q9UJQ7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCP2D1Q9UJQ7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCP2D1Q9UJQ7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCP2D1Q9UJQ7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCP2D1Q9UJQ7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCP2D1Q9UJQ7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCP2D1Q9UJQ7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCP2D1Q9UJQ7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCP2D1Q9UJQ7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCP2D1Q9UJQ7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCP2D1Q9UJQ7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCP2D1Q9UJQ7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCP2D1Q9UJQ7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms