Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD4

CIDEB, Cell death activator CIDE-B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIDEBQ9UHD4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CIDEBQ9UHD4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CIDEBQ9UHD4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CIDEBQ9UHD4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CIDEBQ9UHD4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CIDEBQ9UHD4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CIDEBQ9UHD4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CIDEBQ9UHD4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CIDEBQ9UHD4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CIDEBQ9UHD4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CIDEBQ9UHD4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CIDEBQ9UHD4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CIDEBQ9UHD4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CIDEBQ9UHD4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CIDEBQ9UHD4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CIDEBQ9UHD4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CIDEBQ9UHD4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CIDEBQ9UHD4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CIDEBQ9UHD4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CIDEBQ9UHD4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CIDEBQ9UHD4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CIDEBQ9UHD4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CIDEBQ9UHD4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CIDEBQ9UHD4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CIDEBQ9UHD4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CIDEBQ9UHD4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CIDEBQ9UHD4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CIDEBQ9UHD4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CIDEBQ9UHD4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CIDEBQ9UHD4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CIDEBQ9UHD4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CIDEBQ9UHD4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CIDEBQ9UHD4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CIDEBQ9UHD4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CIDEBQ9UHD4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CIDEBQ9UHD4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CIDEBQ9UHD4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CIDEBQ9UHD4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CIDEBQ9UHD4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CIDEBQ9UHD4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CIDEBQ9UHD4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIDEBQ9UHD4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIDEBQ9UHD4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIDEBQ9UHD4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CIDEBQ9UHD4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CIDEBQ9UHD4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CIDEBQ9UHD4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CIDEBQ9UHD4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIDEBQ9UHD4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIDEBQ9UHD4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIDEBQ9UHD4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIDEBQ9UHD4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIDEBQ9UHD4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CIDEBQ9UHD4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CIDEBQ9UHD4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CIDEBQ9UHD4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CIDEBQ9UHD4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CIDEBQ9UHD4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CIDEBQ9UHD4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CIDEBQ9UHD4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CIDEBQ9UHD4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CIDEBQ9UHD4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CIDEBQ9UHD4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CIDEBQ9UHD4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CIDEBQ9UHD4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CIDEBQ9UHD4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CIDEBQ9UHD4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CIDEBQ9UHD4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CIDEBQ9UHD4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CIDEBQ9UHD4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CIDEBQ9UHD4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CIDEBQ9UHD4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CIDEBQ9UHD4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CIDEBQ9UHD4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CIDEBQ9UHD4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CIDEBQ9UHD4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CIDEBQ9UHD4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CIDEBQ9UHD4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CIDEBQ9UHD4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CIDEBQ9UHD4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CIDEBQ9UHD4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CIDEBQ9UHD4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CIDEBQ9UHD4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CIDEBQ9UHD4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CIDEBQ9UHD4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CIDEBQ9UHD4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CIDEBQ9UHD4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CIDEBQ9UHD4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CIDEBQ9UHD4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CIDEBQ9UHD4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CIDEBQ9UHD4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CIDEBQ9UHD4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CIDEBQ9UHD4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CIDEBQ9UHD4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CIDEBQ9UHD4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CIDEBQ9UHD4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CIDEBQ9UHD4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CIDEBQ9UHD4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CIDEBQ9UHD4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CIDEBQ9UHD4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms