Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPARGC1AQ9UBK2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPARGC1AQ9UBK2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPARGC1AQ9UBK2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPARGC1AQ9UBK2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1AQ9UBK2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPARGC1AQ9UBK2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1AQ9UBK2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPARGC1AQ9UBK2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPARGC1AQ9UBK2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPARGC1AQ9UBK2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPARGC1AQ9UBK2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPARGC1AQ9UBK2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPARGC1AQ9UBK2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPARGC1AQ9UBK2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPARGC1AQ9UBK2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPARGC1AQ9UBK2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPARGC1AQ9UBK2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPARGC1AQ9UBK2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPARGC1AQ9UBK2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPARGC1AQ9UBK2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPARGC1AQ9UBK2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPARGC1AQ9UBK2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPARGC1AQ9UBK2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPARGC1AQ9UBK2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPARGC1AQ9UBK2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPARGC1AQ9UBK2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPARGC1AQ9UBK2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPARGC1AQ9UBK2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1AQ9UBK2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1AQ9UBK2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARGC1AQ9UBK2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1AQ9UBK2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1AQ9UBK2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1AQ9UBK2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1AQ9UBK2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARGC1AQ9UBK2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARGC1AQ9UBK2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1AQ9UBK2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PPARGC1AQ9UBK2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPARGC1AQ9UBK2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPARGC1AQ9UBK2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPARGC1AQ9UBK2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPARGC1AQ9UBK2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPARGC1AQ9UBK2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPARGC1AQ9UBK2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPARGC1AQ9UBK2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPARGC1AQ9UBK2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPARGC1AQ9UBK2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPARGC1AQ9UBK2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPARGC1AQ9UBK2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPARGC1AQ9UBK2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPARGC1AQ9UBK2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1AQ9UBK2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1AQ9UBK2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1AQ9UBK2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARGC1AQ9UBK2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARGC1AQ9UBK2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPARGC1AQ9UBK2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPARGC1AQ9UBK2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPARGC1AQ9UBK2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPARGC1AQ9UBK2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PPARGC1AQ9UBK2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPARGC1AQ9UBK2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPARGC1AQ9UBK2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPARGC1AQ9UBK2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPARGC1AQ9UBK2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPARGC1AQ9UBK2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPARGC1AQ9UBK2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPARGC1AQ9UBK2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARGC1AQ9UBK2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARGC1AQ9UBK2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARGC1AQ9UBK2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARGC1AQ9UBK2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1AQ9UBK2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPARGC1AQ9UBK2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPARGC1AQ9UBK2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPARGC1AQ9UBK2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPARGC1AQ9UBK2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPARGC1AQ9UBK2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PPARGC1AQ9UBK2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPARGC1AQ9UBK2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPARGC1AQ9UBK2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPARGC1AQ9UBK2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPARGC1AQ9UBK2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPARGC1AQ9UBK2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPARGC1AQ9UBK2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPARGC1AQ9UBK2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPARGC1AQ9UBK2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPARGC1AQ9UBK2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms