Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC88CQ9P219 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC88CQ9P219 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC88CQ9P219 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC88CQ9P219 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC88CQ9P219 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC88CQ9P219 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC88CQ9P219 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC88CQ9P219 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC88CQ9P219 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC88CQ9P219 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC88CQ9P219 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC88CQ9P219 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC88CQ9P219 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC88CQ9P219 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC88CQ9P219 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC88CQ9P219 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC88CQ9P219 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC88CQ9P219 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC88CQ9P219 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC88CQ9P219 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC88CQ9P219 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC88CQ9P219 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC88CQ9P219 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC88CQ9P219 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC88CQ9P219 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC88CQ9P219 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC88CQ9P219 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC88CQ9P219 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC88CQ9P219 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC88CQ9P219 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC88CQ9P219 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC88CQ9P219 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC88CQ9P219 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC88CQ9P219 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC88CQ9P219 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC88CQ9P219 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC88CQ9P219 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC88CQ9P219 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC88CQ9P219 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC88CQ9P219 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC88CQ9P219 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC88CQ9P219 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC88CQ9P219 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC88CQ9P219 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC88CQ9P219 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC88CQ9P219 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC88CQ9P219 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC88CQ9P219 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC88CQ9P219 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC88CQ9P219 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC88CQ9P219 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC88CQ9P219 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC88CQ9P219 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC88CQ9P219 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC88CQ9P219 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC88CQ9P219 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC88CQ9P219 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC88CQ9P219 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC88CQ9P219 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC88CQ9P219 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC88CQ9P219 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC88CQ9P219 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC88CQ9P219 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC88CQ9P219 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC88CQ9P219 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC88CQ9P219 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC88CQ9P219 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC88CQ9P219 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC88CQ9P219 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC88CQ9P219 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC88CQ9P219 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC88CQ9P219 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC88CQ9P219 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC88CQ9P219 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC88CQ9P219 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC88CQ9P219 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC88CQ9P219 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC88CQ9P219 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC88CQ9P219 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC88CQ9P219 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC88CQ9P219 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC88CQ9P219 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC88CQ9P219 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC88CQ9P219 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC88CQ9P219 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC88CQ9P219 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC88CQ9P219 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC88CQ9P219 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC88CQ9P219 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC88CQ9P219 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC88CQ9P219 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC88CQ9P219 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC88CQ9P219 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC88CQ9P219 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC88CQ9P219 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC88CQ9P219 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC88CQ9P219 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC88CQ9P219 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC88CQ9P219 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms