Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDHAF2Q9NX18 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDHAF2Q9NX18 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDHAF2Q9NX18 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDHAF2Q9NX18 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDHAF2Q9NX18 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDHAF2Q9NX18 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDHAF2Q9NX18 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDHAF2Q9NX18 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDHAF2Q9NX18 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDHAF2Q9NX18 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDHAF2Q9NX18 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDHAF2Q9NX18 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDHAF2Q9NX18 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHAF2Q9NX18 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDHAF2Q9NX18 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDHAF2Q9NX18 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDHAF2Q9NX18 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDHAF2Q9NX18 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDHAF2Q9NX18 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDHAF2Q9NX18 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDHAF2Q9NX18 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDHAF2Q9NX18 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDHAF2Q9NX18 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDHAF2Q9NX18 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDHAF2Q9NX18 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDHAF2Q9NX18 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDHAF2Q9NX18 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDHAF2Q9NX18 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHAF2Q9NX18 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHAF2Q9NX18 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHAF2Q9NX18 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHAF2Q9NX18 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHAF2Q9NX18 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SDHAF2Q9NX18 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF2Q9NX18 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF2Q9NX18 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAF2Q9NX18 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAF2Q9NX18 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAF2Q9NX18 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAF2Q9NX18 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAF2Q9NX18 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAF2Q9NX18 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHAF2Q9NX18 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHAF2Q9NX18 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHAF2Q9NX18 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHAF2Q9NX18 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHAF2Q9NX18 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHAF2Q9NX18 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHAF2Q9NX18 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHAF2Q9NX18 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDHAF2Q9NX18 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDHAF2Q9NX18 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDHAF2Q9NX18 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDHAF2Q9NX18 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDHAF2Q9NX18 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDHAF2Q9NX18 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHAF2Q9NX18 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHAF2Q9NX18 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDHAF2Q9NX18 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDHAF2Q9NX18 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDHAF2Q9NX18 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDHAF2Q9NX18 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDHAF2Q9NX18 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDHAF2Q9NX18 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHAF2Q9NX18 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHAF2Q9NX18 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHAF2Q9NX18 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDHAF2Q9NX18 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDHAF2Q9NX18 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHAF2Q9NX18 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHAF2Q9NX18 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHAF2Q9NX18 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHAF2Q9NX18 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDHAF2Q9NX18 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF2Q9NX18 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF2Q9NX18 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF2Q9NX18 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF2Q9NX18 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF2Q9NX18 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF2Q9NX18 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHAF2Q9NX18 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHAF2Q9NX18 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHAF2Q9NX18 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHAF2Q9NX18 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHAF2Q9NX18 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF2Q9NX18 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF2Q9NX18 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF2Q9NX18 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF2Q9NX18 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHAF2Q9NX18 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDHAF2Q9NX18 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAF2Q9NX18 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAF2Q9NX18 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAF2Q9NX18 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHAF2Q9NX18 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHAF2Q9NX18 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHAF2Q9NX18 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHAF2Q9NX18 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHAF2Q9NX18 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 389.2 ms