Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB1

RBFOX1, RNA binding protein fox-1 homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX1Q9NWB1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBFOX1Q9NWB1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBFOX1Q9NWB1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBFOX1Q9NWB1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBFOX1Q9NWB1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBFOX1Q9NWB1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBFOX1Q9NWB1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBFOX1Q9NWB1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBFOX1Q9NWB1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBFOX1Q9NWB1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBFOX1Q9NWB1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBFOX1Q9NWB1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RBFOX1Q9NWB1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBFOX1Q9NWB1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBFOX1Q9NWB1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBFOX1Q9NWB1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RBFOX1Q9NWB1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBFOX1Q9NWB1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBFOX1Q9NWB1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBFOX1Q9NWB1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBFOX1Q9NWB1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBFOX1Q9NWB1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBFOX1Q9NWB1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBFOX1Q9NWB1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBFOX1Q9NWB1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBFOX1Q9NWB1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBFOX1Q9NWB1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBFOX1Q9NWB1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBFOX1Q9NWB1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBFOX1Q9NWB1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBFOX1Q9NWB1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBFOX1Q9NWB1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBFOX1Q9NWB1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBFOX1Q9NWB1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBFOX1Q9NWB1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBFOX1Q9NWB1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBFOX1Q9NWB1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBFOX1Q9NWB1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBFOX1Q9NWB1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBFOX1Q9NWB1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBFOX1Q9NWB1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBFOX1Q9NWB1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBFOX1Q9NWB1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBFOX1Q9NWB1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RBFOX1Q9NWB1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBFOX1Q9NWB1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RBFOX1Q9NWB1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBFOX1Q9NWB1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBFOX1Q9NWB1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBFOX1Q9NWB1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBFOX1Q9NWB1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBFOX1Q9NWB1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBFOX1Q9NWB1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBFOX1Q9NWB1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBFOX1Q9NWB1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBFOX1Q9NWB1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBFOX1Q9NWB1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBFOX1Q9NWB1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBFOX1Q9NWB1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBFOX1Q9NWB1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBFOX1Q9NWB1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBFOX1Q9NWB1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBFOX1Q9NWB1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBFOX1Q9NWB1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBFOX1Q9NWB1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBFOX1Q9NWB1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RBFOX1Q9NWB1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBFOX1Q9NWB1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBFOX1Q9NWB1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBFOX1Q9NWB1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBFOX1Q9NWB1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBFOX1Q9NWB1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBFOX1Q9NWB1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBFOX1Q9NWB1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBFOX1Q9NWB1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBFOX1Q9NWB1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBFOX1Q9NWB1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBFOX1Q9NWB1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBFOX1Q9NWB1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBFOX1Q9NWB1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBFOX1Q9NWB1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBFOX1Q9NWB1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBFOX1Q9NWB1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBFOX1Q9NWB1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBFOX1Q9NWB1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBFOX1Q9NWB1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBFOX1Q9NWB1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBFOX1Q9NWB1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBFOX1Q9NWB1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBFOX1Q9NWB1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBFOX1Q9NWB1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RBFOX1Q9NWB1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBFOX1Q9NWB1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBFOX1Q9NWB1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBFOX1Q9NWB1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBFOX1Q9NWB1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBFOX1Q9NWB1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBFOX1Q9NWB1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBFOX1Q9NWB1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBFOX1Q9NWB1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms