Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATAD3AQ9NVI7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATAD3AQ9NVI7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATAD3AQ9NVI7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATAD3AQ9NVI7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATAD3AQ9NVI7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATAD3AQ9NVI7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATAD3AQ9NVI7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATAD3AQ9NVI7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATAD3AQ9NVI7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATAD3AQ9NVI7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATAD3AQ9NVI7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATAD3AQ9NVI7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATAD3AQ9NVI7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATAD3AQ9NVI7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATAD3AQ9NVI7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATAD3AQ9NVI7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATAD3AQ9NVI7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATAD3AQ9NVI7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATAD3AQ9NVI7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATAD3AQ9NVI7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATAD3AQ9NVI7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATAD3AQ9NVI7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATAD3AQ9NVI7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATAD3AQ9NVI7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATAD3AQ9NVI7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATAD3AQ9NVI7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATAD3AQ9NVI7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATAD3AQ9NVI7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAD3AQ9NVI7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAD3AQ9NVI7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAD3AQ9NVI7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAD3AQ9NVI7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATAD3AQ9NVI7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATAD3AQ9NVI7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATAD3AQ9NVI7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATAD3AQ9NVI7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ATAD3AQ9NVI7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATAD3AQ9NVI7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATAD3AQ9NVI7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATAD3AQ9NVI7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATAD3AQ9NVI7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATAD3AQ9NVI7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATAD3AQ9NVI7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ATAD3AQ9NVI7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATAD3AQ9NVI7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATAD3AQ9NVI7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATAD3AQ9NVI7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATAD3AQ9NVI7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ATAD3AQ9NVI7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATAD3AQ9NVI7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATAD3AQ9NVI7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATAD3AQ9NVI7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATAD3AQ9NVI7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATAD3AQ9NVI7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATAD3AQ9NVI7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATAD3AQ9NVI7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATAD3AQ9NVI7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATAD3AQ9NVI7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATAD3AQ9NVI7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATAD3AQ9NVI7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATAD3AQ9NVI7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ATAD3AQ9NVI7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATAD3AQ9NVI7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATAD3AQ9NVI7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATAD3AQ9NVI7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATAD3AQ9NVI7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATAD3AQ9NVI7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD3AQ9NVI7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD3AQ9NVI7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD3AQ9NVI7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATAD3AQ9NVI7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD3AQ9NVI7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD3AQ9NVI7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAD3AQ9NVI7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAD3AQ9NVI7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD3AQ9NVI7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD3AQ9NVI7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD3AQ9NVI7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD3AQ9NVI7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATAD3AQ9NVI7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATAD3AQ9NVI7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATAD3AQ9NVI7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATAD3AQ9NVI7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATAD3AQ9NVI7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATAD3AQ9NVI7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATAD3AQ9NVI7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATAD3AQ9NVI7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATAD3AQ9NVI7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATAD3AQ9NVI7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATAD3AQ9NVI7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATAD3AQ9NVI7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATAD3AQ9NVI7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATAD3AQ9NVI7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATAD3AQ9NVI7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATAD3AQ9NVI7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATAD3AQ9NVI7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms