Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED17Q9NVC6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED17Q9NVC6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED17Q9NVC6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED17Q9NVC6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED17Q9NVC6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED17Q9NVC6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MED17Q9NVC6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED17Q9NVC6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED17Q9NVC6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED17Q9NVC6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED17Q9NVC6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED17Q9NVC6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED17Q9NVC6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MED17Q9NVC6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED17Q9NVC6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED17Q9NVC6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED17Q9NVC6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED17Q9NVC6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MED17Q9NVC6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MED17Q9NVC6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED17Q9NVC6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED17Q9NVC6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED17Q9NVC6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED17Q9NVC6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED17Q9NVC6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MED17Q9NVC6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MED17Q9NVC6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MED17Q9NVC6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED17Q9NVC6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MED17Q9NVC6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED17Q9NVC6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MED17Q9NVC6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MED17Q9NVC6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MED17Q9NVC6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED17Q9NVC6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MED17Q9NVC6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MED17Q9NVC6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MED17Q9NVC6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED17Q9NVC6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED17Q9NVC6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED17Q9NVC6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED17Q9NVC6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED17Q9NVC6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED17Q9NVC6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED17Q9NVC6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED17Q9NVC6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED17Q9NVC6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED17Q9NVC6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED17Q9NVC6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED17Q9NVC6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED17Q9NVC6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED17Q9NVC6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED17Q9NVC6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED17Q9NVC6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED17Q9NVC6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED17Q9NVC6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED17Q9NVC6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED17Q9NVC6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED17Q9NVC6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED17Q9NVC6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED17Q9NVC6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED17Q9NVC6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED17Q9NVC6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED17Q9NVC6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED17Q9NVC6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED17Q9NVC6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED17Q9NVC6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED17Q9NVC6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED17Q9NVC6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED17Q9NVC6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MED17Q9NVC6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED17Q9NVC6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED17Q9NVC6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED17Q9NVC6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED17Q9NVC6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED17Q9NVC6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED17Q9NVC6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED17Q9NVC6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED17Q9NVC6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED17Q9NVC6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED17Q9NVC6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED17Q9NVC6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MED17Q9NVC6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED17Q9NVC6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED17Q9NVC6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED17Q9NVC6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED17Q9NVC6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED17Q9NVC6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED17Q9NVC6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MED17Q9NVC6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED17Q9NVC6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED17Q9NVC6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MED17Q9NVC6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED17Q9NVC6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED17Q9NVC6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED17Q9NVC6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED17Q9NVC6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED17Q9NVC6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MED17Q9NVC6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms