Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR21

PARP11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP11Q9NR21 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP11Q9NR21 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP11Q9NR21 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP11Q9NR21 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP11Q9NR21 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP11Q9NR21 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP11Q9NR21 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP11Q9NR21 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP11Q9NR21 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP11Q9NR21 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP11Q9NR21 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP11Q9NR21 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP11Q9NR21 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP11Q9NR21 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP11Q9NR21 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP11Q9NR21 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP11Q9NR21 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP11Q9NR21 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP11Q9NR21 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP11Q9NR21 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP11Q9NR21 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP11Q9NR21 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP11Q9NR21 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP11Q9NR21 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP11Q9NR21 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP11Q9NR21 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP11Q9NR21 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP11Q9NR21 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP11Q9NR21 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP11Q9NR21 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP11Q9NR21 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP11Q9NR21 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP11Q9NR21 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP11Q9NR21 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP11Q9NR21 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP11Q9NR21 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP11Q9NR21 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP11Q9NR21 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP11Q9NR21 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP11Q9NR21 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP11Q9NR21 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP11Q9NR21 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARP11Q9NR21 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARP11Q9NR21 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP11Q9NR21 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP11Q9NR21 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP11Q9NR21 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP11Q9NR21 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP11Q9NR21 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP11Q9NR21 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP11Q9NR21 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP11Q9NR21 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP11Q9NR21 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP11Q9NR21 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP11Q9NR21 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP11Q9NR21 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP11Q9NR21 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP11Q9NR21 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP11Q9NR21 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP11Q9NR21 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP11Q9NR21 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP11Q9NR21 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP11Q9NR21 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP11Q9NR21 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP11Q9NR21 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PARP11Q9NR21 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP11Q9NR21 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP11Q9NR21 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP11Q9NR21 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARP11Q9NR21 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARP11Q9NR21 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARP11Q9NR21 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARP11Q9NR21 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARP11Q9NR21 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARP11Q9NR21 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARP11Q9NR21 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARP11Q9NR21 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP11Q9NR21 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP11Q9NR21 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP11Q9NR21 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP11Q9NR21 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP11Q9NR21 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARP11Q9NR21 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARP11Q9NR21 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARP11Q9NR21 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP11Q9NR21 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP11Q9NR21 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP11Q9NR21 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARP11Q9NR21 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARP11Q9NR21 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP11Q9NR21 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP11Q9NR21 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP11Q9NR21 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP11Q9NR21 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP11Q9NR21 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP11Q9NR21 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP11Q9NR21 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP11Q9NR21 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP11Q9NR21 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PARP11Q9NR21 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms