Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSU72Q9NP77 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSU72Q9NP77 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSU72Q9NP77 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SSU72Q9NP77 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSU72Q9NP77 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSU72Q9NP77 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSU72Q9NP77 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSU72Q9NP77 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSU72Q9NP77 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSU72Q9NP77 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSU72Q9NP77 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSU72Q9NP77 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSU72Q9NP77 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSU72Q9NP77 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSU72Q9NP77 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSU72Q9NP77 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSU72Q9NP77 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSU72Q9NP77 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSU72Q9NP77 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSU72Q9NP77 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSU72Q9NP77 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSU72Q9NP77 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSU72Q9NP77 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSU72Q9NP77 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSU72Q9NP77 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSU72Q9NP77 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSU72Q9NP77 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSU72Q9NP77 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSU72Q9NP77 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSU72Q9NP77 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SSU72Q9NP77 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SSU72Q9NP77 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSU72Q9NP77 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SSU72Q9NP77 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSU72Q9NP77 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSU72Q9NP77 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSU72Q9NP77 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSU72Q9NP77 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSU72Q9NP77 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSU72Q9NP77 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSU72Q9NP77 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSU72Q9NP77 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSU72Q9NP77 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSU72Q9NP77 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSU72Q9NP77 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSU72Q9NP77 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SSU72Q9NP77 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SSU72Q9NP77 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSU72Q9NP77 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SSU72Q9NP77 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSU72Q9NP77 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SSU72Q9NP77 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSU72Q9NP77 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SSU72Q9NP77 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSU72Q9NP77 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSU72Q9NP77 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSU72Q9NP77 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSU72Q9NP77 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSU72Q9NP77 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSU72Q9NP77 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSU72Q9NP77 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSU72Q9NP77 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSU72Q9NP77 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SSU72Q9NP77 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SSU72Q9NP77 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSU72Q9NP77 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSU72Q9NP77 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSU72Q9NP77 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSU72Q9NP77 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSU72Q9NP77 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSU72Q9NP77 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSU72Q9NP77 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSU72Q9NP77 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSU72Q9NP77 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSU72Q9NP77 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSU72Q9NP77 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSU72Q9NP77 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSU72Q9NP77 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSU72Q9NP77 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSU72Q9NP77 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSU72Q9NP77 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSU72Q9NP77 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSU72Q9NP77 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSU72Q9NP77 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSU72Q9NP77 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSU72Q9NP77 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSU72Q9NP77 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSU72Q9NP77 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSU72Q9NP77 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSU72Q9NP77 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SSU72Q9NP77 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SSU72Q9NP77 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SSU72Q9NP77 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SSU72Q9NP77 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSU72Q9NP77 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSU72Q9NP77 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSU72Q9NP77 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSU72Q9NP77 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSU72Q9NP77 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms