Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PDCL3Q9H2J4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDCL3Q9H2J4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PDCL3Q9H2J4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PDCL3Q9H2J4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PDCL3Q9H2J4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PDCL3Q9H2J4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PDCL3Q9H2J4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PDCL3Q9H2J4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PDCL3Q9H2J4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PDCL3Q9H2J4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PDCL3Q9H2J4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PDCL3Q9H2J4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDCL3Q9H2J4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDCL3Q9H2J4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDCL3Q9H2J4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDCL3Q9H2J4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDCL3Q9H2J4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDCL3Q9H2J4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDCL3Q9H2J4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDCL3Q9H2J4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDCL3Q9H2J4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDCL3Q9H2J4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDCL3Q9H2J4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDCL3Q9H2J4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDCL3Q9H2J4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PDCL3Q9H2J4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDCL3Q9H2J4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDCL3Q9H2J4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDCL3Q9H2J4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDCL3Q9H2J4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDCL3Q9H2J4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDCL3Q9H2J4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDCL3Q9H2J4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDCL3Q9H2J4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDCL3Q9H2J4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDCL3Q9H2J4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDCL3Q9H2J4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDCL3Q9H2J4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDCL3Q9H2J4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDCL3Q9H2J4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDCL3Q9H2J4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDCL3Q9H2J4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PDCL3Q9H2J4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDCL3Q9H2J4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDCL3Q9H2J4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDCL3Q9H2J4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDCL3Q9H2J4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDCL3Q9H2J4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDCL3Q9H2J4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDCL3Q9H2J4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDCL3Q9H2J4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDCL3Q9H2J4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDCL3Q9H2J4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDCL3Q9H2J4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDCL3Q9H2J4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDCL3Q9H2J4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDCL3Q9H2J4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDCL3Q9H2J4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDCL3Q9H2J4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDCL3Q9H2J4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDCL3Q9H2J4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDCL3Q9H2J4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDCL3Q9H2J4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDCL3Q9H2J4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDCL3Q9H2J4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms