Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHARPINQ9H0F6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHARPINQ9H0F6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHARPINQ9H0F6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SHARPINQ9H0F6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHARPINQ9H0F6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHARPINQ9H0F6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHARPINQ9H0F6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHARPINQ9H0F6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHARPINQ9H0F6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHARPINQ9H0F6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHARPINQ9H0F6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHARPINQ9H0F6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHARPINQ9H0F6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHARPINQ9H0F6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHARPINQ9H0F6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHARPINQ9H0F6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHARPINQ9H0F6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHARPINQ9H0F6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHARPINQ9H0F6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHARPINQ9H0F6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHARPINQ9H0F6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHARPINQ9H0F6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHARPINQ9H0F6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHARPINQ9H0F6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHARPINQ9H0F6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHARPINQ9H0F6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHARPINQ9H0F6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHARPINQ9H0F6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHARPINQ9H0F6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHARPINQ9H0F6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHARPINQ9H0F6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SHARPINQ9H0F6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHARPINQ9H0F6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHARPINQ9H0F6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHARPINQ9H0F6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHARPINQ9H0F6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHARPINQ9H0F6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHARPINQ9H0F6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHARPINQ9H0F6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHARPINQ9H0F6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHARPINQ9H0F6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHARPINQ9H0F6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHARPINQ9H0F6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHARPINQ9H0F6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHARPINQ9H0F6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHARPINQ9H0F6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHARPINQ9H0F6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SHARPINQ9H0F6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHARPINQ9H0F6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHARPINQ9H0F6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHARPINQ9H0F6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHARPINQ9H0F6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHARPINQ9H0F6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHARPINQ9H0F6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHARPINQ9H0F6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHARPINQ9H0F6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHARPINQ9H0F6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHARPINQ9H0F6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHARPINQ9H0F6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHARPINQ9H0F6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHARPINQ9H0F6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHARPINQ9H0F6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHARPINQ9H0F6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHARPINQ9H0F6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHARPINQ9H0F6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHARPINQ9H0F6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHARPINQ9H0F6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHARPINQ9H0F6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHARPINQ9H0F6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SHARPINQ9H0F6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHARPINQ9H0F6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHARPINQ9H0F6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHARPINQ9H0F6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHARPINQ9H0F6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHARPINQ9H0F6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHARPINQ9H0F6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SHARPINQ9H0F6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHARPINQ9H0F6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHARPINQ9H0F6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHARPINQ9H0F6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHARPINQ9H0F6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHARPINQ9H0F6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHARPINQ9H0F6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHARPINQ9H0F6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SHARPINQ9H0F6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHARPINQ9H0F6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHARPINQ9H0F6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHARPINQ9H0F6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHARPINQ9H0F6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHARPINQ9H0F6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHARPINQ9H0F6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHARPINQ9H0F6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHARPINQ9H0F6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHARPINQ9H0F6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHARPINQ9H0F6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHARPINQ9H0F6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHARPINQ9H0F6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHARPINQ9H0F6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHARPINQ9H0F6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.7 ms