Protein–RNA interactions for Protein: Q9C040

TRIM2, Tripartite motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM2Q9C040 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM2Q9C040 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM2Q9C040 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM2Q9C040 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM2Q9C040 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM2Q9C040 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM2Q9C040 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM2Q9C040 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM2Q9C040 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM2Q9C040 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM2Q9C040 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM2Q9C040 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM2Q9C040 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM2Q9C040 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM2Q9C040 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM2Q9C040 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM2Q9C040 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM2Q9C040 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM2Q9C040 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM2Q9C040 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM2Q9C040 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM2Q9C040 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM2Q9C040 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM2Q9C040 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIM2Q9C040 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM2Q9C040 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM2Q9C040 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM2Q9C040 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM2Q9C040 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM2Q9C040 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM2Q9C040 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM2Q9C040 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM2Q9C040 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM2Q9C040 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM2Q9C040 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM2Q9C040 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM2Q9C040 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM2Q9C040 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM2Q9C040 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM2Q9C040 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM2Q9C040 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM2Q9C040 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM2Q9C040 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM2Q9C040 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM2Q9C040 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM2Q9C040 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM2Q9C040 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM2Q9C040 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM2Q9C040 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM2Q9C040 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM2Q9C040 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM2Q9C040 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM2Q9C040 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM2Q9C040 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM2Q9C040 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM2Q9C040 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM2Q9C040 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM2Q9C040 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM2Q9C040 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM2Q9C040 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM2Q9C040 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM2Q9C040 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM2Q9C040 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM2Q9C040 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM2Q9C040 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM2Q9C040 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM2Q9C040 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM2Q9C040 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM2Q9C040 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM2Q9C040 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM2Q9C040 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM2Q9C040 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM2Q9C040 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM2Q9C040 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM2Q9C040 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM2Q9C040 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM2Q9C040 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM2Q9C040 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM2Q9C040 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM2Q9C040 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM2Q9C040 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM2Q9C040 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM2Q9C040 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM2Q9C040 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM2Q9C040 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM2Q9C040 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM2Q9C040 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM2Q9C040 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM2Q9C040 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM2Q9C040 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM2Q9C040 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM2Q9C040 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM2Q9C040 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM2Q9C040 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM2Q9C040 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM2Q9C040 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM2Q9C040 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM2Q9C040 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM2Q9C040 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM2Q9C040 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.9 ms