Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM15Q9C019 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM15Q9C019 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM15Q9C019 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM15Q9C019 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM15Q9C019 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM15Q9C019 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM15Q9C019 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM15Q9C019 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM15Q9C019 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM15Q9C019 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM15Q9C019 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM15Q9C019 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM15Q9C019 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM15Q9C019 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM15Q9C019 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM15Q9C019 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM15Q9C019 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM15Q9C019 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIM15Q9C019 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM15Q9C019 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM15Q9C019 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM15Q9C019 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM15Q9C019 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM15Q9C019 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM15Q9C019 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM15Q9C019 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM15Q9C019 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM15Q9C019 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM15Q9C019 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM15Q9C019 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM15Q9C019 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM15Q9C019 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM15Q9C019 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM15Q9C019 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM15Q9C019 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM15Q9C019 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM15Q9C019 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM15Q9C019 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM15Q9C019 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM15Q9C019 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM15Q9C019 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM15Q9C019 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM15Q9C019 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM15Q9C019 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM15Q9C019 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM15Q9C019 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM15Q9C019 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM15Q9C019 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM15Q9C019 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM15Q9C019 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM15Q9C019 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM15Q9C019 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM15Q9C019 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM15Q9C019 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM15Q9C019 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM15Q9C019 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM15Q9C019 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM15Q9C019 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM15Q9C019 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM15Q9C019 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM15Q9C019 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM15Q9C019 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM15Q9C019 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM15Q9C019 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM15Q9C019 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM15Q9C019 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM15Q9C019 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM15Q9C019 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM15Q9C019 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM15Q9C019 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM15Q9C019 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM15Q9C019 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM15Q9C019 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM15Q9C019 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM15Q9C019 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM15Q9C019 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM15Q9C019 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM15Q9C019 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM15Q9C019 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM15Q9C019 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM15Q9C019 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM15Q9C019 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM15Q9C019 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM15Q9C019 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM15Q9C019 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM15Q9C019 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM15Q9C019 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM15Q9C019 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM15Q9C019 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM15Q9C019 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM15Q9C019 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM15Q9C019 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM15Q9C019 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM15Q9C019 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM15Q9C019 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM15Q9C019 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM15Q9C019 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM15Q9C019 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM15Q9C019 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms