Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRIM15Q9C019 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TRIM15Q9C019 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRIM15Q9C019 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TRIM15Q9C019 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRIM15Q9C019 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRIM15Q9C019 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRIM15Q9C019 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
TRIM15Q9C019 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TRIM15Q9C019 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRIM15Q9C019 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM15Q9C019 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRIM15Q9C019 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRIM15Q9C019 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRIM15Q9C019 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRIM15Q9C019 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRIM15Q9C019 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRIM15Q9C019 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRIM15Q9C019 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM15Q9C019 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM15Q9C019 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM15Q9C019 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM15Q9C019 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM15Q9C019 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM15Q9C019 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM15Q9C019 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM15Q9C019 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM15Q9C019 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM15Q9C019 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM15Q9C019 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM15Q9C019 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM15Q9C019 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM15Q9C019 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM15Q9C019 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM15Q9C019 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM15Q9C019 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM15Q9C019 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIM15Q9C019 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM15Q9C019 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM15Q9C019 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM15Q9C019 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM15Q9C019 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM15Q9C019 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM15Q9C019 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM15Q9C019 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM15Q9C019 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM15Q9C019 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM15Q9C019 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM15Q9C019 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM15Q9C019 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM15Q9C019 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM15Q9C019 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM15Q9C019 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM15Q9C019 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM15Q9C019 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM15Q9C019 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM15Q9C019 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM15Q9C019 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM15Q9C019 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM15Q9C019 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM15Q9C019 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM15Q9C019 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM15Q9C019 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM15Q9C019 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM15Q9C019 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM15Q9C019 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM15Q9C019 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM15Q9C019 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM15Q9C019 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM15Q9C019 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM15Q9C019 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM15Q9C019 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM15Q9C019 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM15Q9C019 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM15Q9C019 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM15Q9C019 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM15Q9C019 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM15Q9C019 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM15Q9C019 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM15Q9C019 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM15Q9C019 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM15Q9C019 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM15Q9C019 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM15Q9C019 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM15Q9C019 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM15Q9C019 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM15Q9C019 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM15Q9C019 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM15Q9C019 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM15Q9C019 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM15Q9C019 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM15Q9C019 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM15Q9C019 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM15Q9C019 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM15Q9C019 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM15Q9C019 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM15Q9C019 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM15Q9C019 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM15Q9C019 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM15Q9C019 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms