Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM3Q9BZL3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM3Q9BZL3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM3Q9BZL3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM3Q9BZL3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM3Q9BZL3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM3Q9BZL3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM3Q9BZL3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM3Q9BZL3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM3Q9BZL3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM3Q9BZL3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM3Q9BZL3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM3Q9BZL3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM3Q9BZL3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM3Q9BZL3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM3Q9BZL3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM3Q9BZL3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM3Q9BZL3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM3Q9BZL3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM3Q9BZL3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM3Q9BZL3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM3Q9BZL3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM3Q9BZL3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM3Q9BZL3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM3Q9BZL3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM3Q9BZL3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM3Q9BZL3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM3Q9BZL3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM3Q9BZL3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM3Q9BZL3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM3Q9BZL3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM3Q9BZL3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM3Q9BZL3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM3Q9BZL3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM3Q9BZL3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM3Q9BZL3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM3Q9BZL3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM3Q9BZL3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM3Q9BZL3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM3Q9BZL3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM3Q9BZL3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM3Q9BZL3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM3Q9BZL3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM3Q9BZL3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM3Q9BZL3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM3Q9BZL3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMIM3Q9BZL3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM3Q9BZL3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM3Q9BZL3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM3Q9BZL3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM3Q9BZL3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM3Q9BZL3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM3Q9BZL3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM3Q9BZL3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM3Q9BZL3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM3Q9BZL3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM3Q9BZL3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM3Q9BZL3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM3Q9BZL3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM3Q9BZL3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM3Q9BZL3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM3Q9BZL3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM3Q9BZL3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM3Q9BZL3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM3Q9BZL3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM3Q9BZL3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM3Q9BZL3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM3Q9BZL3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM3Q9BZL3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM3Q9BZL3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM3Q9BZL3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM3Q9BZL3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM3Q9BZL3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM3Q9BZL3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM3Q9BZL3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM3Q9BZL3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM3Q9BZL3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM3Q9BZL3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM3Q9BZL3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM3Q9BZL3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM3Q9BZL3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM3Q9BZL3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM3Q9BZL3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM3Q9BZL3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM3Q9BZL3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM3Q9BZL3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM3Q9BZL3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM3Q9BZL3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM3Q9BZL3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM3Q9BZL3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM3Q9BZL3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM3Q9BZL3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM3Q9BZL3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM3Q9BZL3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM3Q9BZL3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM3Q9BZL3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM3Q9BZL3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM3Q9BZL3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM3Q9BZL3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms