Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM3Q9BZL3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM3Q9BZL3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM3Q9BZL3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM3Q9BZL3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM3Q9BZL3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM3Q9BZL3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM3Q9BZL3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM3Q9BZL3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM3Q9BZL3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM3Q9BZL3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM3Q9BZL3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM3Q9BZL3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM3Q9BZL3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM3Q9BZL3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMIM3Q9BZL3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM3Q9BZL3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM3Q9BZL3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM3Q9BZL3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM3Q9BZL3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM3Q9BZL3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM3Q9BZL3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM3Q9BZL3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM3Q9BZL3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM3Q9BZL3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM3Q9BZL3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM3Q9BZL3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM3Q9BZL3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM3Q9BZL3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM3Q9BZL3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM3Q9BZL3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM3Q9BZL3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM3Q9BZL3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM3Q9BZL3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM3Q9BZL3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM3Q9BZL3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM3Q9BZL3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM3Q9BZL3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM3Q9BZL3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM3Q9BZL3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM3Q9BZL3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM3Q9BZL3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM3Q9BZL3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM3Q9BZL3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM3Q9BZL3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM3Q9BZL3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM3Q9BZL3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM3Q9BZL3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM3Q9BZL3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM3Q9BZL3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMIM3Q9BZL3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMIM3Q9BZL3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMIM3Q9BZL3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMIM3Q9BZL3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMIM3Q9BZL3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM3Q9BZL3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM3Q9BZL3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM3Q9BZL3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM3Q9BZL3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM3Q9BZL3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM3Q9BZL3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM3Q9BZL3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM3Q9BZL3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM3Q9BZL3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM3Q9BZL3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM3Q9BZL3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM3Q9BZL3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM3Q9BZL3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM3Q9BZL3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM3Q9BZL3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM3Q9BZL3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM3Q9BZL3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM3Q9BZL3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM3Q9BZL3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM3Q9BZL3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM3Q9BZL3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM3Q9BZL3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM3Q9BZL3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM3Q9BZL3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM3Q9BZL3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM3Q9BZL3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM3Q9BZL3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM3Q9BZL3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM3Q9BZL3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM3Q9BZL3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM3Q9BZL3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM3Q9BZL3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM3Q9BZL3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM3Q9BZL3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM3Q9BZL3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM3Q9BZL3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM3Q9BZL3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM3Q9BZL3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM3Q9BZL3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM3Q9BZL3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM3Q9BZL3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM3Q9BZL3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM3Q9BZL3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms