Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM2

DPCD, Protein DPCD, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPCDQ9BVM2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DPCDQ9BVM2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DPCDQ9BVM2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DPCDQ9BVM2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DPCDQ9BVM2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DPCDQ9BVM2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DPCDQ9BVM2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DPCDQ9BVM2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DPCDQ9BVM2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DPCDQ9BVM2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DPCDQ9BVM2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DPCDQ9BVM2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DPCDQ9BVM2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DPCDQ9BVM2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DPCDQ9BVM2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DPCDQ9BVM2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DPCDQ9BVM2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DPCDQ9BVM2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DPCDQ9BVM2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DPCDQ9BVM2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DPCDQ9BVM2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DPCDQ9BVM2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DPCDQ9BVM2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DPCDQ9BVM2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DPCDQ9BVM2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DPCDQ9BVM2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DPCDQ9BVM2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DPCDQ9BVM2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DPCDQ9BVM2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DPCDQ9BVM2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DPCDQ9BVM2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DPCDQ9BVM2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DPCDQ9BVM2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DPCDQ9BVM2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DPCDQ9BVM2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DPCDQ9BVM2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DPCDQ9BVM2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DPCDQ9BVM2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DPCDQ9BVM2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DPCDQ9BVM2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DPCDQ9BVM2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DPCDQ9BVM2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DPCDQ9BVM2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DPCDQ9BVM2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DPCDQ9BVM2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DPCDQ9BVM2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DPCDQ9BVM2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DPCDQ9BVM2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DPCDQ9BVM2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DPCDQ9BVM2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DPCDQ9BVM2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DPCDQ9BVM2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DPCDQ9BVM2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DPCDQ9BVM2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DPCDQ9BVM2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DPCDQ9BVM2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DPCDQ9BVM2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DPCDQ9BVM2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
DPCDQ9BVM2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DPCDQ9BVM2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DPCDQ9BVM2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DPCDQ9BVM2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DPCDQ9BVM2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DPCDQ9BVM2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DPCDQ9BVM2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DPCDQ9BVM2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DPCDQ9BVM2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DPCDQ9BVM2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DPCDQ9BVM2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DPCDQ9BVM2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DPCDQ9BVM2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DPCDQ9BVM2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DPCDQ9BVM2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DPCDQ9BVM2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DPCDQ9BVM2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DPCDQ9BVM2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DPCDQ9BVM2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DPCDQ9BVM2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DPCDQ9BVM2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DPCDQ9BVM2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DPCDQ9BVM2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DPCDQ9BVM2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DPCDQ9BVM2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DPCDQ9BVM2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DPCDQ9BVM2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DPCDQ9BVM2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DPCDQ9BVM2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DPCDQ9BVM2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DPCDQ9BVM2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DPCDQ9BVM2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DPCDQ9BVM2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DPCDQ9BVM2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DPCDQ9BVM2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DPCDQ9BVM2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DPCDQ9BVM2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DPCDQ9BVM2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DPCDQ9BVM2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DPCDQ9BVM2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DPCDQ9BVM2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DPCDQ9BVM2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms