Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGMATQ9BSE5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGMATQ9BSE5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGMATQ9BSE5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGMATQ9BSE5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGMATQ9BSE5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGMATQ9BSE5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGMATQ9BSE5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGMATQ9BSE5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGMATQ9BSE5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGMATQ9BSE5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGMATQ9BSE5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGMATQ9BSE5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGMATQ9BSE5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGMATQ9BSE5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGMATQ9BSE5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGMATQ9BSE5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGMATQ9BSE5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGMATQ9BSE5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGMATQ9BSE5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGMATQ9BSE5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGMATQ9BSE5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGMATQ9BSE5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGMATQ9BSE5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGMATQ9BSE5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGMATQ9BSE5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGMATQ9BSE5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGMATQ9BSE5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGMATQ9BSE5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGMATQ9BSE5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGMATQ9BSE5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGMATQ9BSE5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGMATQ9BSE5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGMATQ9BSE5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGMATQ9BSE5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AGMATQ9BSE5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGMATQ9BSE5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGMATQ9BSE5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGMATQ9BSE5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGMATQ9BSE5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGMATQ9BSE5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGMATQ9BSE5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGMATQ9BSE5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGMATQ9BSE5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGMATQ9BSE5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGMATQ9BSE5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGMATQ9BSE5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGMATQ9BSE5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGMATQ9BSE5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGMATQ9BSE5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGMATQ9BSE5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGMATQ9BSE5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AGMATQ9BSE5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGMATQ9BSE5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGMATQ9BSE5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGMATQ9BSE5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGMATQ9BSE5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGMATQ9BSE5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGMATQ9BSE5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGMATQ9BSE5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGMATQ9BSE5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AGMATQ9BSE5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGMATQ9BSE5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGMATQ9BSE5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGMATQ9BSE5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGMATQ9BSE5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGMATQ9BSE5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGMATQ9BSE5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGMATQ9BSE5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGMATQ9BSE5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGMATQ9BSE5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGMATQ9BSE5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGMATQ9BSE5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGMATQ9BSE5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AGMATQ9BSE5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGMATQ9BSE5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGMATQ9BSE5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGMATQ9BSE5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGMATQ9BSE5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGMATQ9BSE5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGMATQ9BSE5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGMATQ9BSE5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGMATQ9BSE5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGMATQ9BSE5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGMATQ9BSE5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGMATQ9BSE5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGMATQ9BSE5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGMATQ9BSE5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGMATQ9BSE5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGMATQ9BSE5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGMATQ9BSE5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGMATQ9BSE5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGMATQ9BSE5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGMATQ9BSE5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGMATQ9BSE5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGMATQ9BSE5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGMATQ9BSE5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGMATQ9BSE5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGMATQ9BSE5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGMATQ9BSE5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms