Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR3

TMEM246, Transmembrane protein 246, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM246Q9BRR3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM246Q9BRR3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM246Q9BRR3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM246Q9BRR3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM246Q9BRR3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM246Q9BRR3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM246Q9BRR3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM246Q9BRR3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM246Q9BRR3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM246Q9BRR3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM246Q9BRR3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM246Q9BRR3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM246Q9BRR3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM246Q9BRR3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM246Q9BRR3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM246Q9BRR3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM246Q9BRR3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM246Q9BRR3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM246Q9BRR3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM246Q9BRR3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM246Q9BRR3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM246Q9BRR3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM246Q9BRR3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM246Q9BRR3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM246Q9BRR3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM246Q9BRR3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM246Q9BRR3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM246Q9BRR3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM246Q9BRR3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM246Q9BRR3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM246Q9BRR3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM246Q9BRR3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM246Q9BRR3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM246Q9BRR3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM246Q9BRR3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM246Q9BRR3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM246Q9BRR3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM246Q9BRR3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM246Q9BRR3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM246Q9BRR3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM246Q9BRR3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM246Q9BRR3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM246Q9BRR3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM246Q9BRR3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM246Q9BRR3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM246Q9BRR3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM246Q9BRR3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM246Q9BRR3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM246Q9BRR3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM246Q9BRR3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM246Q9BRR3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM246Q9BRR3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM246Q9BRR3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM246Q9BRR3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM246Q9BRR3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM246Q9BRR3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM246Q9BRR3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM246Q9BRR3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM246Q9BRR3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM246Q9BRR3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM246Q9BRR3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM246Q9BRR3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM246Q9BRR3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM246Q9BRR3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM246Q9BRR3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM246Q9BRR3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM246Q9BRR3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM246Q9BRR3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM246Q9BRR3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM246Q9BRR3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM246Q9BRR3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM246Q9BRR3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM246Q9BRR3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM246Q9BRR3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM246Q9BRR3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM246Q9BRR3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM246Q9BRR3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM246Q9BRR3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM246Q9BRR3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM246Q9BRR3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM246Q9BRR3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM246Q9BRR3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM246Q9BRR3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM246Q9BRR3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM246Q9BRR3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM246Q9BRR3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM246Q9BRR3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM246Q9BRR3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM246Q9BRR3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM246Q9BRR3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM246Q9BRR3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM246Q9BRR3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM246Q9BRR3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM246Q9BRR3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM246Q9BRR3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM246Q9BRR3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM246Q9BRR3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM246Q9BRR3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM246Q9BRR3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM246Q9BRR3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms