Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GFI1Q99684 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GFI1Q99684 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GFI1Q99684 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GFI1Q99684 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFI1Q99684 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFI1Q99684 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GFI1Q99684 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GFI1Q99684 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GFI1Q99684 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GFI1Q99684 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GFI1Q99684 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GFI1Q99684 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GFI1Q99684 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GFI1Q99684 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GFI1Q99684 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GFI1Q99684 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GFI1Q99684 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GFI1Q99684 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GFI1Q99684 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GFI1Q99684 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GFI1Q99684 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GFI1Q99684 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GFI1Q99684 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GFI1Q99684 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GFI1Q99684 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GFI1Q99684 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GFI1Q99684 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GFI1Q99684 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GFI1Q99684 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFI1Q99684 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFI1Q99684 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFI1Q99684 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GFI1Q99684 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GFI1Q99684 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GFI1Q99684 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GFI1Q99684 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GFI1Q99684 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GFI1Q99684 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFI1Q99684 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFI1Q99684 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GFI1Q99684 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GFI1Q99684 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFI1Q99684 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFI1Q99684 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GFI1Q99684 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GFI1Q99684 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFI1Q99684 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFI1Q99684 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFI1Q99684 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFI1Q99684 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFI1Q99684 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GFI1Q99684 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GFI1Q99684 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GFI1Q99684 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GFI1Q99684 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GFI1Q99684 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFI1Q99684 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFI1Q99684 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFI1Q99684 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GFI1Q99684 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GFI1Q99684 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GFI1Q99684 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GFI1Q99684 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GFI1Q99684 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFI1Q99684 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFI1Q99684 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFI1Q99684 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFI1Q99684 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFI1Q99684 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFI1Q99684 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GFI1Q99684 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GFI1Q99684 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GFI1Q99684 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GFI1Q99684 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GFI1Q99684 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GFI1Q99684 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GFI1Q99684 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GFI1Q99684 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GFI1Q99684 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GFI1Q99684 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GFI1Q99684 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GFI1Q99684 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GFI1Q99684 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GFI1Q99684 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GFI1Q99684 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GFI1Q99684 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GFI1Q99684 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GFI1Q99684 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GFI1Q99684 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GFI1Q99684 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GFI1Q99684 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GFI1Q99684 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GFI1Q99684 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GFI1Q99684 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GFI1Q99684 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GFI1Q99684 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GFI1Q99684 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GFI1Q99684 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GFI1Q99684 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms