Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MMS19Q96T76 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MMS19Q96T76 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MMS19Q96T76 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MMS19Q96T76 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MMS19Q96T76 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MMS19Q96T76 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MMS19Q96T76 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MMS19Q96T76 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MMS19Q96T76 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MMS19Q96T76 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MMS19Q96T76 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MMS19Q96T76 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MMS19Q96T76 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MMS19Q96T76 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MMS19Q96T76 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
MMS19Q96T76 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MMS19Q96T76 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MMS19Q96T76 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MMS19Q96T76 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MMS19Q96T76 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MMS19Q96T76 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MMS19Q96T76 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MMS19Q96T76 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MMS19Q96T76 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MMS19Q96T76 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MMS19Q96T76 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MMS19Q96T76 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MMS19Q96T76 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MMS19Q96T76 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MMS19Q96T76 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MMS19Q96T76 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MMS19Q96T76 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MMS19Q96T76 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MMS19Q96T76 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MMS19Q96T76 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MMS19Q96T76 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MMS19Q96T76 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MMS19Q96T76 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MMS19Q96T76 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MMS19Q96T76 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MMS19Q96T76 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MMS19Q96T76 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MMS19Q96T76 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MMS19Q96T76 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MMS19Q96T76 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
MMS19Q96T76 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
MMS19Q96T76 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MMS19Q96T76 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MMS19Q96T76 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MMS19Q96T76 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MMS19Q96T76 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MMS19Q96T76 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MMS19Q96T76 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MMS19Q96T76 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MMS19Q96T76 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MMS19Q96T76 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MMS19Q96T76 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MMS19Q96T76 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MMS19Q96T76 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MMS19Q96T76 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
MMS19Q96T76 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MMS19Q96T76 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MMS19Q96T76 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MMS19Q96T76 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MMS19Q96T76 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MMS19Q96T76 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MMS19Q96T76 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MMS19Q96T76 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MMS19Q96T76 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MMS19Q96T76 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MMS19Q96T76 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MMS19Q96T76 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MMS19Q96T76 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MMS19Q96T76 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MMS19Q96T76 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MMS19Q96T76 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MMS19Q96T76 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MMS19Q96T76 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MMS19Q96T76 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MMS19Q96T76 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MMS19Q96T76 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MMS19Q96T76 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MMS19Q96T76 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
MMS19Q96T76 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MMS19Q96T76 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MMS19Q96T76 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MMS19Q96T76 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MMS19Q96T76 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MMS19Q96T76 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MMS19Q96T76 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MMS19Q96T76 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MMS19Q96T76 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MMS19Q96T76 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MMS19Q96T76 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MMS19Q96T76 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MMS19Q96T76 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MMS19Q96T76 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MMS19Q96T76 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MMS19Q96T76 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms