Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RPS6KC1Q96S38 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RPS6KC1Q96S38 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RPS6KC1Q96S38 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RPS6KC1Q96S38 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RPS6KC1Q96S38 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RPS6KC1Q96S38 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPS6KC1Q96S38 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
RPS6KC1Q96S38 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RPS6KC1Q96S38 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RPS6KC1Q96S38 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RPS6KC1Q96S38 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RPS6KC1Q96S38 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RPS6KC1Q96S38 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RPS6KC1Q96S38 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RPS6KC1Q96S38 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RPS6KC1Q96S38 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RPS6KC1Q96S38 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RPS6KC1Q96S38 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RPS6KC1Q96S38 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RPS6KC1Q96S38 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPS6KC1Q96S38 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPS6KC1Q96S38 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPS6KC1Q96S38 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
RPS6KC1Q96S38 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPS6KC1Q96S38 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPS6KC1Q96S38 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RPS6KC1Q96S38 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RPS6KC1Q96S38 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RPS6KC1Q96S38 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPS6KC1Q96S38 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPS6KC1Q96S38 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RPS6KC1Q96S38 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RPS6KC1Q96S38 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RPS6KC1Q96S38 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RPS6KC1Q96S38 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RPS6KC1Q96S38 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RPS6KC1Q96S38 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
RPS6KC1Q96S38 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RPS6KC1Q96S38 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RPS6KC1Q96S38 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RPS6KC1Q96S38 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RPS6KC1Q96S38 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RPS6KC1Q96S38 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RPS6KC1Q96S38 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RPS6KC1Q96S38 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RPS6KC1Q96S38 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPS6KC1Q96S38 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPS6KC1Q96S38 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPS6KC1Q96S38 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPS6KC1Q96S38 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPS6KC1Q96S38 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPS6KC1Q96S38 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPS6KC1Q96S38 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPS6KC1Q96S38 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPS6KC1Q96S38 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPS6KC1Q96S38 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPS6KC1Q96S38 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
RPS6KC1Q96S38 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPS6KC1Q96S38 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPS6KC1Q96S38 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RPS6KC1Q96S38 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
RPS6KC1Q96S38 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPS6KC1Q96S38 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPS6KC1Q96S38 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
RPS6KC1Q96S38 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPS6KC1Q96S38 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPS6KC1Q96S38 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPS6KC1Q96S38 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPS6KC1Q96S38 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPS6KC1Q96S38 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPS6KC1Q96S38 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPS6KC1Q96S38 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPS6KC1Q96S38 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPS6KC1Q96S38 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPS6KC1Q96S38 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPS6KC1Q96S38 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPS6KC1Q96S38 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPS6KC1Q96S38 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPS6KC1Q96S38 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPS6KC1Q96S38 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPS6KC1Q96S38 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPS6KC1Q96S38 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPS6KC1Q96S38 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPS6KC1Q96S38 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPS6KC1Q96S38 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPS6KC1Q96S38 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPS6KC1Q96S38 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPS6KC1Q96S38 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RPS6KC1Q96S38 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RPS6KC1Q96S38 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPS6KC1Q96S38 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPS6KC1Q96S38 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RPS6KC1Q96S38 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RPS6KC1Q96S38 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RPS6KC1Q96S38 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RPS6KC1Q96S38 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RPS6KC1Q96S38 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RPS6KC1Q96S38 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RPS6KC1Q96S38 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms