Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.57
RPS6KC1Q96S38 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RPS6KC1Q96S38 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RPS6KC1Q96S38 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RPS6KC1Q96S38 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RPS6KC1Q96S38 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RPS6KC1Q96S38 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36■■■■□ 3.35
RPS6KC1Q96S38 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RPS6KC1Q96S38 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RPS6KC1Q96S38 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RPS6KC1Q96S38 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RPS6KC1Q96S38 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RPS6KC1Q96S38 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RPS6KC1Q96S38 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
RPS6KC1Q96S38 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RPS6KC1Q96S38 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RPS6KC1Q96S38 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
RPS6KC1Q96S38 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RPS6KC1Q96S38 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RPS6KC1Q96S38 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RPS6KC1Q96S38 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RPS6KC1Q96S38 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RPS6KC1Q96S38 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RPS6KC1Q96S38 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RPS6KC1Q96S38 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RPS6KC1Q96S38 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RPS6KC1Q96S38 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RPS6KC1Q96S38 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RPS6KC1Q96S38 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RPS6KC1Q96S38 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RPS6KC1Q96S38 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RPS6KC1Q96S38 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RPS6KC1Q96S38 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RPS6KC1Q96S38 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RPS6KC1Q96S38 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RPS6KC1Q96S38 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RPS6KC1Q96S38 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RPS6KC1Q96S38 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RPS6KC1Q96S38 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RPS6KC1Q96S38 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RPS6KC1Q96S38 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RPS6KC1Q96S38 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RPS6KC1Q96S38 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RPS6KC1Q96S38 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
RPS6KC1Q96S38 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RPS6KC1Q96S38 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RPS6KC1Q96S38 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
RPS6KC1Q96S38 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
RPS6KC1Q96S38 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RPS6KC1Q96S38 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RPS6KC1Q96S38 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
RPS6KC1Q96S38 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RPS6KC1Q96S38 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
RPS6KC1Q96S38 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RPS6KC1Q96S38 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RPS6KC1Q96S38 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RPS6KC1Q96S38 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RPS6KC1Q96S38 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RPS6KC1Q96S38 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RPS6KC1Q96S38 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RPS6KC1Q96S38 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RPS6KC1Q96S38 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RPS6KC1Q96S38 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RPS6KC1Q96S38 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RPS6KC1Q96S38 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RPS6KC1Q96S38 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RPS6KC1Q96S38 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RPS6KC1Q96S38 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RPS6KC1Q96S38 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RPS6KC1Q96S38 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RPS6KC1Q96S38 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RPS6KC1Q96S38 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RPS6KC1Q96S38 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RPS6KC1Q96S38 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RPS6KC1Q96S38 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RPS6KC1Q96S38 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RPS6KC1Q96S38 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RPS6KC1Q96S38 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RPS6KC1Q96S38 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
RPS6KC1Q96S38 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RPS6KC1Q96S38 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RPS6KC1Q96S38 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
RPS6KC1Q96S38 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RPS6KC1Q96S38 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RPS6KC1Q96S38 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RPS6KC1Q96S38 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RPS6KC1Q96S38 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RPS6KC1Q96S38 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
RPS6KC1Q96S38 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RPS6KC1Q96S38 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
RPS6KC1Q96S38 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RPS6KC1Q96S38 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
RPS6KC1Q96S38 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RPS6KC1Q96S38 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RPS6KC1Q96S38 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
RPS6KC1Q96S38 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RPS6KC1Q96S38 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RPS6KC1Q96S38 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RPS6KC1Q96S38 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RPS6KC1Q96S38 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms