Protein–RNA interactions for Protein: Q96QI5

HS3ST6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST6Q96QI5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS3ST6Q96QI5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HS3ST6Q96QI5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HS3ST6Q96QI5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HS3ST6Q96QI5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HS3ST6Q96QI5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HS3ST6Q96QI5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HS3ST6Q96QI5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HS3ST6Q96QI5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HS3ST6Q96QI5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HS3ST6Q96QI5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HS3ST6Q96QI5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HS3ST6Q96QI5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HS3ST6Q96QI5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HS3ST6Q96QI5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HS3ST6Q96QI5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HS3ST6Q96QI5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HS3ST6Q96QI5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HS3ST6Q96QI5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HS3ST6Q96QI5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HS3ST6Q96QI5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HS3ST6Q96QI5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HS3ST6Q96QI5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HS3ST6Q96QI5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HS3ST6Q96QI5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HS3ST6Q96QI5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HS3ST6Q96QI5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HS3ST6Q96QI5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HS3ST6Q96QI5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HS3ST6Q96QI5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HS3ST6Q96QI5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HS3ST6Q96QI5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HS3ST6Q96QI5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HS3ST6Q96QI5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HS3ST6Q96QI5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HS3ST6Q96QI5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HS3ST6Q96QI5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HS3ST6Q96QI5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HS3ST6Q96QI5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HS3ST6Q96QI5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HS3ST6Q96QI5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HS3ST6Q96QI5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HS3ST6Q96QI5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HS3ST6Q96QI5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HS3ST6Q96QI5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HS3ST6Q96QI5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HS3ST6Q96QI5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HS3ST6Q96QI5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HS3ST6Q96QI5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HS3ST6Q96QI5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HS3ST6Q96QI5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HS3ST6Q96QI5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HS3ST6Q96QI5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HS3ST6Q96QI5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HS3ST6Q96QI5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HS3ST6Q96QI5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HS3ST6Q96QI5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HS3ST6Q96QI5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HS3ST6Q96QI5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HS3ST6Q96QI5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HS3ST6Q96QI5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HS3ST6Q96QI5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HS3ST6Q96QI5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HS3ST6Q96QI5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HS3ST6Q96QI5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HS3ST6Q96QI5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HS3ST6Q96QI5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HS3ST6Q96QI5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HS3ST6Q96QI5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HS3ST6Q96QI5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HS3ST6Q96QI5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HS3ST6Q96QI5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HS3ST6Q96QI5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HS3ST6Q96QI5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HS3ST6Q96QI5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HS3ST6Q96QI5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HS3ST6Q96QI5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HS3ST6Q96QI5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HS3ST6Q96QI5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HS3ST6Q96QI5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HS3ST6Q96QI5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HS3ST6Q96QI5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HS3ST6Q96QI5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HS3ST6Q96QI5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HS3ST6Q96QI5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HS3ST6Q96QI5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HS3ST6Q96QI5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HS3ST6Q96QI5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HS3ST6Q96QI5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HS3ST6Q96QI5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HS3ST6Q96QI5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HS3ST6Q96QI5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HS3ST6Q96QI5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HS3ST6Q96QI5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HS3ST6Q96QI5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HS3ST6Q96QI5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HS3ST6Q96QI5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HS3ST6Q96QI5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HS3ST6Q96QI5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HS3ST6Q96QI5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms