Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CMTM3Q96MX0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CMTM3Q96MX0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CMTM3Q96MX0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CMTM3Q96MX0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CMTM3Q96MX0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CMTM3Q96MX0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CMTM3Q96MX0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CMTM3Q96MX0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMTM3Q96MX0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTM3Q96MX0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTM3Q96MX0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMTM3Q96MX0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CMTM3Q96MX0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CMTM3Q96MX0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CMTM3Q96MX0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CMTM3Q96MX0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CMTM3Q96MX0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CMTM3Q96MX0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CMTM3Q96MX0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CMTM3Q96MX0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CMTM3Q96MX0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CMTM3Q96MX0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CMTM3Q96MX0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CMTM3Q96MX0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CMTM3Q96MX0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CMTM3Q96MX0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CMTM3Q96MX0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CMTM3Q96MX0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CMTM3Q96MX0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CMTM3Q96MX0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CMTM3Q96MX0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CMTM3Q96MX0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CMTM3Q96MX0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CMTM3Q96MX0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CMTM3Q96MX0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CMTM3Q96MX0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CMTM3Q96MX0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CMTM3Q96MX0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CMTM3Q96MX0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CMTM3Q96MX0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CMTM3Q96MX0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CMTM3Q96MX0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CMTM3Q96MX0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMTM3Q96MX0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CMTM3Q96MX0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CMTM3Q96MX0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CMTM3Q96MX0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMTM3Q96MX0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMTM3Q96MX0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMTM3Q96MX0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CMTM3Q96MX0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CMTM3Q96MX0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CMTM3Q96MX0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CMTM3Q96MX0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CMTM3Q96MX0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMTM3Q96MX0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMTM3Q96MX0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMTM3Q96MX0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CMTM3Q96MX0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CMTM3Q96MX0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CMTM3Q96MX0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMTM3Q96MX0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMTM3Q96MX0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMTM3Q96MX0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMTM3Q96MX0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMTM3Q96MX0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CMTM3Q96MX0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CMTM3Q96MX0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CMTM3Q96MX0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CMTM3Q96MX0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMTM3Q96MX0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CMTM3Q96MX0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CMTM3Q96MX0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CMTM3Q96MX0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM3Q96MX0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM3Q96MX0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CMTM3Q96MX0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CMTM3Q96MX0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CMTM3Q96MX0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CMTM3Q96MX0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CMTM3Q96MX0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CMTM3Q96MX0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CMTM3Q96MX0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CMTM3Q96MX0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CMTM3Q96MX0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CMTM3Q96MX0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CMTM3Q96MX0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CMTM3Q96MX0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CMTM3Q96MX0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMTM3Q96MX0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMTM3Q96MX0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMTM3Q96MX0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMTM3Q96MX0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMTM3Q96MX0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMTM3Q96MX0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMTM3Q96MX0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMTM3Q96MX0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMTM3Q96MX0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMTM3Q96MX0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms