Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CABS1Q96KC9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CABS1Q96KC9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CABS1Q96KC9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABS1Q96KC9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABS1Q96KC9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CABS1Q96KC9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABS1Q96KC9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABS1Q96KC9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABS1Q96KC9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CABS1Q96KC9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CABS1Q96KC9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CABS1Q96KC9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CABS1Q96KC9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABS1Q96KC9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABS1Q96KC9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABS1Q96KC9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABS1Q96KC9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABS1Q96KC9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CABS1Q96KC9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABS1Q96KC9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABS1Q96KC9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABS1Q96KC9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABS1Q96KC9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CABS1Q96KC9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABS1Q96KC9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABS1Q96KC9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABS1Q96KC9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABS1Q96KC9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABS1Q96KC9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABS1Q96KC9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABS1Q96KC9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABS1Q96KC9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABS1Q96KC9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABS1Q96KC9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABS1Q96KC9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABS1Q96KC9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABS1Q96KC9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CABS1Q96KC9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CABS1Q96KC9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABS1Q96KC9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CABS1Q96KC9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABS1Q96KC9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABS1Q96KC9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CABS1Q96KC9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CABS1Q96KC9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABS1Q96KC9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CABS1Q96KC9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CABS1Q96KC9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CABS1Q96KC9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CABS1Q96KC9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CABS1Q96KC9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABS1Q96KC9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CABS1Q96KC9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CABS1Q96KC9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABS1Q96KC9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABS1Q96KC9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABS1Q96KC9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABS1Q96KC9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABS1Q96KC9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CABS1Q96KC9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABS1Q96KC9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABS1Q96KC9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABS1Q96KC9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABS1Q96KC9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABS1Q96KC9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABS1Q96KC9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABS1Q96KC9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABS1Q96KC9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CABS1Q96KC9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CABS1Q96KC9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABS1Q96KC9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CABS1Q96KC9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CABS1Q96KC9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CABS1Q96KC9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CABS1Q96KC9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CABS1Q96KC9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CABS1Q96KC9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CABS1Q96KC9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CABS1Q96KC9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CABS1Q96KC9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CABS1Q96KC9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CABS1Q96KC9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CABS1Q96KC9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CABS1Q96KC9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CABS1Q96KC9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CABS1Q96KC9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CABS1Q96KC9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CABS1Q96KC9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CABS1Q96KC9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CABS1Q96KC9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CABS1Q96KC9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CABS1Q96KC9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CABS1Q96KC9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CABS1Q96KC9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CABS1Q96KC9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CABS1Q96KC9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CABS1Q96KC9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CABS1Q96KC9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CABS1Q96KC9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms