Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTP4Q96DX8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTP4Q96DX8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTP4Q96DX8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTP4Q96DX8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RTP4Q96DX8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTP4Q96DX8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTP4Q96DX8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTP4Q96DX8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTP4Q96DX8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTP4Q96DX8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTP4Q96DX8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTP4Q96DX8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTP4Q96DX8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTP4Q96DX8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTP4Q96DX8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTP4Q96DX8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTP4Q96DX8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTP4Q96DX8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTP4Q96DX8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTP4Q96DX8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTP4Q96DX8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTP4Q96DX8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTP4Q96DX8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTP4Q96DX8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTP4Q96DX8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTP4Q96DX8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTP4Q96DX8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTP4Q96DX8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTP4Q96DX8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTP4Q96DX8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTP4Q96DX8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RTP4Q96DX8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RTP4Q96DX8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RTP4Q96DX8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RTP4Q96DX8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RTP4Q96DX8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTP4Q96DX8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RTP4Q96DX8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTP4Q96DX8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RTP4Q96DX8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RTP4Q96DX8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTP4Q96DX8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTP4Q96DX8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTP4Q96DX8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTP4Q96DX8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTP4Q96DX8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTP4Q96DX8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTP4Q96DX8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTP4Q96DX8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTP4Q96DX8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTP4Q96DX8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTP4Q96DX8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTP4Q96DX8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTP4Q96DX8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTP4Q96DX8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTP4Q96DX8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTP4Q96DX8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTP4Q96DX8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTP4Q96DX8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RTP4Q96DX8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTP4Q96DX8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTP4Q96DX8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTP4Q96DX8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTP4Q96DX8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTP4Q96DX8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTP4Q96DX8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTP4Q96DX8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTP4Q96DX8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTP4Q96DX8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTP4Q96DX8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTP4Q96DX8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTP4Q96DX8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTP4Q96DX8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTP4Q96DX8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTP4Q96DX8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTP4Q96DX8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTP4Q96DX8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTP4Q96DX8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTP4Q96DX8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTP4Q96DX8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTP4Q96DX8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTP4Q96DX8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTP4Q96DX8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTP4Q96DX8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RTP4Q96DX8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTP4Q96DX8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTP4Q96DX8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTP4Q96DX8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTP4Q96DX8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTP4Q96DX8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTP4Q96DX8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTP4Q96DX8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTP4Q96DX8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTP4Q96DX8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTP4Q96DX8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTP4Q96DX8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTP4Q96DX8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTP4Q96DX8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTP4Q96DX8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms