Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NSMCE1Q8WV22 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NSMCE1Q8WV22 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NSMCE1Q8WV22 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NSMCE1Q8WV22 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NSMCE1Q8WV22 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NSMCE1Q8WV22 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NSMCE1Q8WV22 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NSMCE1Q8WV22 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NSMCE1Q8WV22 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NSMCE1Q8WV22 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NSMCE1Q8WV22 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NSMCE1Q8WV22 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NSMCE1Q8WV22 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NSMCE1Q8WV22 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NSMCE1Q8WV22 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSMCE1Q8WV22 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NSMCE1Q8WV22 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NSMCE1Q8WV22 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NSMCE1Q8WV22 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSMCE1Q8WV22 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSMCE1Q8WV22 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSMCE1Q8WV22 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSMCE1Q8WV22 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSMCE1Q8WV22 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSMCE1Q8WV22 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSMCE1Q8WV22 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSMCE1Q8WV22 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSMCE1Q8WV22 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSMCE1Q8WV22 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSMCE1Q8WV22 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSMCE1Q8WV22 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSMCE1Q8WV22 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSMCE1Q8WV22 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSMCE1Q8WV22 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NSMCE1Q8WV22 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSMCE1Q8WV22 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSMCE1Q8WV22 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSMCE1Q8WV22 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSMCE1Q8WV22 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSMCE1Q8WV22 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSMCE1Q8WV22 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSMCE1Q8WV22 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NSMCE1Q8WV22 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NSMCE1Q8WV22 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NSMCE1Q8WV22 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NSMCE1Q8WV22 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NSMCE1Q8WV22 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NSMCE1Q8WV22 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSMCE1Q8WV22 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSMCE1Q8WV22 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NSMCE1Q8WV22 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NSMCE1Q8WV22 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NSMCE1Q8WV22 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NSMCE1Q8WV22 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NSMCE1Q8WV22 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NSMCE1Q8WV22 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NSMCE1Q8WV22 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSMCE1Q8WV22 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSMCE1Q8WV22 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSMCE1Q8WV22 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSMCE1Q8WV22 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NSMCE1Q8WV22 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NSMCE1Q8WV22 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NSMCE1Q8WV22 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NSMCE1Q8WV22 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NSMCE1Q8WV22 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSMCE1Q8WV22 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSMCE1Q8WV22 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NSMCE1Q8WV22 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NSMCE1Q8WV22 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NSMCE1Q8WV22 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NSMCE1Q8WV22 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NSMCE1Q8WV22 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NSMCE1Q8WV22 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NSMCE1Q8WV22 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NSMCE1Q8WV22 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSMCE1Q8WV22 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSMCE1Q8WV22 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSMCE1Q8WV22 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSMCE1Q8WV22 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSMCE1Q8WV22 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NSMCE1Q8WV22 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSMCE1Q8WV22 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSMCE1Q8WV22 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSMCE1Q8WV22 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NSMCE1Q8WV22 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSMCE1Q8WV22 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSMCE1Q8WV22 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSMCE1Q8WV22 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSMCE1Q8WV22 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NSMCE1Q8WV22 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSMCE1Q8WV22 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSMCE1Q8WV22 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSMCE1Q8WV22 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSMCE1Q8WV22 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSMCE1Q8WV22 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSMCE1Q8WV22 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSMCE1Q8WV22 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSMCE1Q8WV22 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms