Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB37

GATD1, Glutamine amidotransferase-like class 1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATD1Q8NB37 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GATD1Q8NB37 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GATD1Q8NB37 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATD1Q8NB37 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATD1Q8NB37 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATD1Q8NB37 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATD1Q8NB37 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATD1Q8NB37 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GATD1Q8NB37 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATD1Q8NB37 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATD1Q8NB37 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATD1Q8NB37 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATD1Q8NB37 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATD1Q8NB37 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATD1Q8NB37 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATD1Q8NB37 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GATD1Q8NB37 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATD1Q8NB37 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATD1Q8NB37 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATD1Q8NB37 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GATD1Q8NB37 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATD1Q8NB37 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATD1Q8NB37 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATD1Q8NB37 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATD1Q8NB37 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATD1Q8NB37 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATD1Q8NB37 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATD1Q8NB37 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATD1Q8NB37 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATD1Q8NB37 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATD1Q8NB37 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATD1Q8NB37 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATD1Q8NB37 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATD1Q8NB37 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATD1Q8NB37 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATD1Q8NB37 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATD1Q8NB37 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GATD1Q8NB37 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GATD1Q8NB37 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GATD1Q8NB37 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GATD1Q8NB37 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GATD1Q8NB37 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GATD1Q8NB37 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GATD1Q8NB37 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GATD1Q8NB37 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GATD1Q8NB37 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GATD1Q8NB37 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GATD1Q8NB37 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GATD1Q8NB37 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GATD1Q8NB37 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GATD1Q8NB37 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GATD1Q8NB37 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GATD1Q8NB37 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GATD1Q8NB37 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GATD1Q8NB37 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GATD1Q8NB37 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GATD1Q8NB37 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GATD1Q8NB37 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GATD1Q8NB37 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GATD1Q8NB37 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GATD1Q8NB37 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GATD1Q8NB37 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATD1Q8NB37 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATD1Q8NB37 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATD1Q8NB37 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GATD1Q8NB37 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GATD1Q8NB37 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GATD1Q8NB37 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GATD1Q8NB37 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATD1Q8NB37 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATD1Q8NB37 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATD1Q8NB37 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATD1Q8NB37 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATD1Q8NB37 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATD1Q8NB37 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATD1Q8NB37 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATD1Q8NB37 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATD1Q8NB37 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATD1Q8NB37 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATD1Q8NB37 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATD1Q8NB37 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATD1Q8NB37 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATD1Q8NB37 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATD1Q8NB37 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATD1Q8NB37 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATD1Q8NB37 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATD1Q8NB37 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATD1Q8NB37 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATD1Q8NB37 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATD1Q8NB37 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATD1Q8NB37 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATD1Q8NB37 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATD1Q8NB37 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATD1Q8NB37 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATD1Q8NB37 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATD1Q8NB37 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATD1Q8NB37 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATD1Q8NB37 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATD1Q8NB37 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATD1Q8NB37 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms