Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZV5

RDH10, Retinol dehydrogenase 10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH10Q8IZV5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RDH10Q8IZV5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RDH10Q8IZV5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RDH10Q8IZV5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RDH10Q8IZV5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RDH10Q8IZV5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RDH10Q8IZV5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RDH10Q8IZV5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RDH10Q8IZV5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RDH10Q8IZV5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RDH10Q8IZV5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RDH10Q8IZV5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RDH10Q8IZV5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RDH10Q8IZV5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RDH10Q8IZV5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDH10Q8IZV5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RDH10Q8IZV5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RDH10Q8IZV5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RDH10Q8IZV5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RDH10Q8IZV5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDH10Q8IZV5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RDH10Q8IZV5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDH10Q8IZV5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RDH10Q8IZV5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RDH10Q8IZV5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RDH10Q8IZV5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RDH10Q8IZV5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RDH10Q8IZV5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RDH10Q8IZV5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RDH10Q8IZV5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RDH10Q8IZV5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RDH10Q8IZV5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RDH10Q8IZV5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RDH10Q8IZV5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RDH10Q8IZV5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RDH10Q8IZV5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RDH10Q8IZV5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RDH10Q8IZV5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RDH10Q8IZV5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDH10Q8IZV5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDH10Q8IZV5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RDH10Q8IZV5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RDH10Q8IZV5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDH10Q8IZV5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDH10Q8IZV5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RDH10Q8IZV5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RDH10Q8IZV5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH10Q8IZV5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH10Q8IZV5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RDH10Q8IZV5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RDH10Q8IZV5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDH10Q8IZV5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH10Q8IZV5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH10Q8IZV5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH10Q8IZV5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH10Q8IZV5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RDH10Q8IZV5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RDH10Q8IZV5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RDH10Q8IZV5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDH10Q8IZV5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDH10Q8IZV5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RDH10Q8IZV5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RDH10Q8IZV5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RDH10Q8IZV5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RDH10Q8IZV5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RDH10Q8IZV5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDH10Q8IZV5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDH10Q8IZV5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDH10Q8IZV5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDH10Q8IZV5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
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