Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVJ1

SLC41A1, Solute carrier family 41 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A1Q8IVJ1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC41A1Q8IVJ1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC41A1Q8IVJ1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC41A1Q8IVJ1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC41A1Q8IVJ1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC41A1Q8IVJ1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLC41A1Q8IVJ1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC41A1Q8IVJ1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC41A1Q8IVJ1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC41A1Q8IVJ1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC41A1Q8IVJ1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC41A1Q8IVJ1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC41A1Q8IVJ1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC41A1Q8IVJ1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC41A1Q8IVJ1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC41A1Q8IVJ1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC41A1Q8IVJ1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC41A1Q8IVJ1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC41A1Q8IVJ1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC41A1Q8IVJ1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC41A1Q8IVJ1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC41A1Q8IVJ1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC41A1Q8IVJ1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC41A1Q8IVJ1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC41A1Q8IVJ1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC41A1Q8IVJ1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC41A1Q8IVJ1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC41A1Q8IVJ1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC41A1Q8IVJ1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC41A1Q8IVJ1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC41A1Q8IVJ1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC41A1Q8IVJ1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC41A1Q8IVJ1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC41A1Q8IVJ1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC41A1Q8IVJ1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC41A1Q8IVJ1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC41A1Q8IVJ1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC41A1Q8IVJ1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC41A1Q8IVJ1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC41A1Q8IVJ1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC41A1Q8IVJ1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC41A1Q8IVJ1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC41A1Q8IVJ1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC41A1Q8IVJ1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC41A1Q8IVJ1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC41A1Q8IVJ1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC41A1Q8IVJ1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC41A1Q8IVJ1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC41A1Q8IVJ1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC41A1Q8IVJ1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC41A1Q8IVJ1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC41A1Q8IVJ1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC41A1Q8IVJ1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC41A1Q8IVJ1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC41A1Q8IVJ1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC41A1Q8IVJ1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC41A1Q8IVJ1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC41A1Q8IVJ1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC41A1Q8IVJ1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC41A1Q8IVJ1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC41A1Q8IVJ1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC41A1Q8IVJ1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC41A1Q8IVJ1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC41A1Q8IVJ1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC41A1Q8IVJ1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC41A1Q8IVJ1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC41A1Q8IVJ1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC41A1Q8IVJ1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC41A1Q8IVJ1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC41A1Q8IVJ1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC41A1Q8IVJ1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC41A1Q8IVJ1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC41A1Q8IVJ1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC41A1Q8IVJ1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC41A1Q8IVJ1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC41A1Q8IVJ1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC41A1Q8IVJ1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC41A1Q8IVJ1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC41A1Q8IVJ1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC41A1Q8IVJ1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC41A1Q8IVJ1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC41A1Q8IVJ1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC41A1Q8IVJ1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC41A1Q8IVJ1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC41A1Q8IVJ1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC41A1Q8IVJ1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC41A1Q8IVJ1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC41A1Q8IVJ1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC41A1Q8IVJ1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC41A1Q8IVJ1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC41A1Q8IVJ1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC41A1Q8IVJ1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC41A1Q8IVJ1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC41A1Q8IVJ1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC41A1Q8IVJ1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC41A1Q8IVJ1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC41A1Q8IVJ1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC41A1Q8IVJ1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC41A1Q8IVJ1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC41A1Q8IVJ1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms