Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP43Q70EL4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP43Q70EL4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP43Q70EL4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP43Q70EL4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP43Q70EL4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP43Q70EL4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP43Q70EL4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP43Q70EL4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP43Q70EL4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP43Q70EL4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP43Q70EL4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP43Q70EL4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP43Q70EL4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP43Q70EL4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP43Q70EL4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP43Q70EL4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP43Q70EL4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP43Q70EL4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP43Q70EL4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP43Q70EL4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP43Q70EL4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP43Q70EL4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP43Q70EL4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP43Q70EL4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP43Q70EL4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP43Q70EL4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP43Q70EL4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP43Q70EL4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP43Q70EL4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP43Q70EL4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP43Q70EL4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP43Q70EL4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP43Q70EL4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP43Q70EL4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP43Q70EL4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP43Q70EL4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP43Q70EL4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP43Q70EL4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP43Q70EL4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP43Q70EL4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP43Q70EL4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP43Q70EL4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP43Q70EL4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP43Q70EL4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP43Q70EL4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP43Q70EL4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP43Q70EL4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP43Q70EL4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP43Q70EL4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP43Q70EL4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP43Q70EL4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP43Q70EL4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP43Q70EL4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP43Q70EL4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP43Q70EL4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP43Q70EL4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP43Q70EL4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP43Q70EL4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP43Q70EL4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP43Q70EL4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP43Q70EL4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP43Q70EL4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP43Q70EL4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP43Q70EL4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP43Q70EL4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP43Q70EL4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP43Q70EL4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP43Q70EL4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP43Q70EL4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP43Q70EL4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP43Q70EL4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP43Q70EL4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP43Q70EL4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP43Q70EL4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP43Q70EL4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP43Q70EL4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP43Q70EL4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP43Q70EL4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP43Q70EL4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP43Q70EL4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP43Q70EL4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP43Q70EL4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP43Q70EL4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP43Q70EL4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP43Q70EL4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP43Q70EL4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP43Q70EL4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP43Q70EL4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP43Q70EL4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP43Q70EL4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP43Q70EL4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP43Q70EL4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP43Q70EL4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP43Q70EL4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP43Q70EL4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP43Q70EL4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP43Q70EL4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP43Q70EL4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP43Q70EL4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms