Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTL4Q6ZR62 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTL4Q6ZR62 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RTL4Q6ZR62 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTL4Q6ZR62 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTL4Q6ZR62 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTL4Q6ZR62 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTL4Q6ZR62 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTL4Q6ZR62 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTL4Q6ZR62 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTL4Q6ZR62 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTL4Q6ZR62 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTL4Q6ZR62 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTL4Q6ZR62 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTL4Q6ZR62 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTL4Q6ZR62 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTL4Q6ZR62 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RTL4Q6ZR62 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTL4Q6ZR62 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RTL4Q6ZR62 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTL4Q6ZR62 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTL4Q6ZR62 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTL4Q6ZR62 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTL4Q6ZR62 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTL4Q6ZR62 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTL4Q6ZR62 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTL4Q6ZR62 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTL4Q6ZR62 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTL4Q6ZR62 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTL4Q6ZR62 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTL4Q6ZR62 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTL4Q6ZR62 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTL4Q6ZR62 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTL4Q6ZR62 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTL4Q6ZR62 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RTL4Q6ZR62 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RTL4Q6ZR62 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RTL4Q6ZR62 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTL4Q6ZR62 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTL4Q6ZR62 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTL4Q6ZR62 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTL4Q6ZR62 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTL4Q6ZR62 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTL4Q6ZR62 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTL4Q6ZR62 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTL4Q6ZR62 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTL4Q6ZR62 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTL4Q6ZR62 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTL4Q6ZR62 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RTL4Q6ZR62 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTL4Q6ZR62 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTL4Q6ZR62 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTL4Q6ZR62 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTL4Q6ZR62 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RTL4Q6ZR62 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTL4Q6ZR62 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTL4Q6ZR62 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL4Q6ZR62 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL4Q6ZR62 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL4Q6ZR62 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL4Q6ZR62 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTL4Q6ZR62 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTL4Q6ZR62 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL4Q6ZR62 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL4Q6ZR62 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTL4Q6ZR62 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTL4Q6ZR62 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTL4Q6ZR62 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTL4Q6ZR62 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTL4Q6ZR62 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTL4Q6ZR62 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL4Q6ZR62 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL4Q6ZR62 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL4Q6ZR62 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL4Q6ZR62 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTL4Q6ZR62 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTL4Q6ZR62 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTL4Q6ZR62 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTL4Q6ZR62 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTL4Q6ZR62 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTL4Q6ZR62 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTL4Q6ZR62 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTL4Q6ZR62 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTL4Q6ZR62 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTL4Q6ZR62 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTL4Q6ZR62 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTL4Q6ZR62 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTL4Q6ZR62 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTL4Q6ZR62 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTL4Q6ZR62 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTL4Q6ZR62 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTL4Q6ZR62 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTL4Q6ZR62 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTL4Q6ZR62 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTL4Q6ZR62 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTL4Q6ZR62 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTL4Q6ZR62 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTL4Q6ZR62 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTL4Q6ZR62 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTL4Q6ZR62 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms