Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF544Q6NX49 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF544Q6NX49 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF544Q6NX49 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF544Q6NX49 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF544Q6NX49 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF544Q6NX49 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF544Q6NX49 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF544Q6NX49 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF544Q6NX49 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF544Q6NX49 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF544Q6NX49 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF544Q6NX49 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF544Q6NX49 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF544Q6NX49 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF544Q6NX49 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF544Q6NX49 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF544Q6NX49 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF544Q6NX49 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF544Q6NX49 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF544Q6NX49 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF544Q6NX49 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZNF544Q6NX49 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF544Q6NX49 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF544Q6NX49 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF544Q6NX49 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF544Q6NX49 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF544Q6NX49 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF544Q6NX49 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF544Q6NX49 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF544Q6NX49 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF544Q6NX49 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF544Q6NX49 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF544Q6NX49 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF544Q6NX49 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF544Q6NX49 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF544Q6NX49 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF544Q6NX49 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF544Q6NX49 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF544Q6NX49 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF544Q6NX49 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF544Q6NX49 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF544Q6NX49 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF544Q6NX49 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF544Q6NX49 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF544Q6NX49 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF544Q6NX49 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF544Q6NX49 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF544Q6NX49 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF544Q6NX49 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF544Q6NX49 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF544Q6NX49 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF544Q6NX49 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF544Q6NX49 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF544Q6NX49 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF544Q6NX49 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF544Q6NX49 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF544Q6NX49 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF544Q6NX49 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF544Q6NX49 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF544Q6NX49 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF544Q6NX49 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF544Q6NX49 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF544Q6NX49 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF544Q6NX49 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF544Q6NX49 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF544Q6NX49 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF544Q6NX49 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF544Q6NX49 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF544Q6NX49 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF544Q6NX49 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF544Q6NX49 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF544Q6NX49 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF544Q6NX49 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF544Q6NX49 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF544Q6NX49 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF544Q6NX49 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF544Q6NX49 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF544Q6NX49 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF544Q6NX49 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF544Q6NX49 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF544Q6NX49 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF544Q6NX49 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF544Q6NX49 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF544Q6NX49 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF544Q6NX49 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF544Q6NX49 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF544Q6NX49 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF544Q6NX49 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF544Q6NX49 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF544Q6NX49 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF544Q6NX49 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF544Q6NX49 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF544Q6NX49 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF544Q6NX49 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF544Q6NX49 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF544Q6NX49 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF544Q6NX49 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF544Q6NX49 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF544Q6NX49 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms