Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLIPQ5VWP3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MLIPQ5VWP3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MLIPQ5VWP3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MLIPQ5VWP3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MLIPQ5VWP3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MLIPQ5VWP3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MLIPQ5VWP3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MLIPQ5VWP3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MLIPQ5VWP3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MLIPQ5VWP3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MLIPQ5VWP3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MLIPQ5VWP3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MLIPQ5VWP3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MLIPQ5VWP3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MLIPQ5VWP3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MLIPQ5VWP3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MLIPQ5VWP3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MLIPQ5VWP3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MLIPQ5VWP3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MLIPQ5VWP3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MLIPQ5VWP3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MLIPQ5VWP3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MLIPQ5VWP3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MLIPQ5VWP3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MLIPQ5VWP3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MLIPQ5VWP3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MLIPQ5VWP3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MLIPQ5VWP3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MLIPQ5VWP3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MLIPQ5VWP3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MLIPQ5VWP3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MLIPQ5VWP3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MLIPQ5VWP3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MLIPQ5VWP3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MLIPQ5VWP3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MLIPQ5VWP3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MLIPQ5VWP3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MLIPQ5VWP3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLIPQ5VWP3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLIPQ5VWP3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MLIPQ5VWP3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLIPQ5VWP3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLIPQ5VWP3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLIPQ5VWP3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MLIPQ5VWP3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MLIPQ5VWP3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MLIPQ5VWP3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MLIPQ5VWP3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MLIPQ5VWP3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MLIPQ5VWP3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MLIPQ5VWP3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MLIPQ5VWP3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MLIPQ5VWP3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MLIPQ5VWP3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MLIPQ5VWP3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MLIPQ5VWP3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MLIPQ5VWP3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MLIPQ5VWP3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MLIPQ5VWP3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MLIPQ5VWP3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MLIPQ5VWP3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLIPQ5VWP3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MLIPQ5VWP3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MLIPQ5VWP3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MLIPQ5VWP3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MLIPQ5VWP3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MLIPQ5VWP3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MLIPQ5VWP3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MLIPQ5VWP3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MLIPQ5VWP3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MLIPQ5VWP3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MLIPQ5VWP3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MLIPQ5VWP3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLIPQ5VWP3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLIPQ5VWP3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLIPQ5VWP3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLIPQ5VWP3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLIPQ5VWP3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MLIPQ5VWP3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MLIPQ5VWP3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MLIPQ5VWP3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MLIPQ5VWP3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MLIPQ5VWP3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MLIPQ5VWP3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MLIPQ5VWP3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MLIPQ5VWP3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MLIPQ5VWP3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MLIPQ5VWP3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLIPQ5VWP3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MLIPQ5VWP3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MLIPQ5VWP3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MLIPQ5VWP3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MLIPQ5VWP3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MLIPQ5VWP3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MLIPQ5VWP3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MLIPQ5VWP3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MLIPQ5VWP3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLIPQ5VWP3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLIPQ5VWP3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms