Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYW2

ANKRD20A1, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A1, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A1Q5TYW2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ANKRD20A1Q5TYW2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ANKRD20A1Q5TYW2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ANKRD20A1Q5TYW2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ANKRD20A1Q5TYW2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ANKRD20A1Q5TYW2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ANKRD20A1Q5TYW2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ANKRD20A1Q5TYW2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ANKRD20A1Q5TYW2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ANKRD20A1Q5TYW2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ANKRD20A1Q5TYW2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ANKRD20A1Q5TYW2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ANKRD20A1Q5TYW2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ANKRD20A1Q5TYW2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ANKRD20A1Q5TYW2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ANKRD20A1Q5TYW2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ANKRD20A1Q5TYW2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ANKRD20A1Q5TYW2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ANKRD20A1Q5TYW2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ANKRD20A1Q5TYW2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ANKRD20A1Q5TYW2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ANKRD20A1Q5TYW2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ANKRD20A1Q5TYW2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ANKRD20A1Q5TYW2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ANKRD20A1Q5TYW2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ANKRD20A1Q5TYW2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ANKRD20A1Q5TYW2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ANKRD20A1Q5TYW2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ANKRD20A1Q5TYW2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ANKRD20A1Q5TYW2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ANKRD20A1Q5TYW2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ANKRD20A1Q5TYW2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ANKRD20A1Q5TYW2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ANKRD20A1Q5TYW2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ANKRD20A1Q5TYW2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANKRD20A1Q5TYW2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANKRD20A1Q5TYW2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANKRD20A1Q5TYW2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANKRD20A1Q5TYW2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANKRD20A1Q5TYW2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ANKRD20A1Q5TYW2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ANKRD20A1Q5TYW2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD20A1Q5TYW2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ANKRD20A1Q5TYW2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ANKRD20A1Q5TYW2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ANKRD20A1Q5TYW2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ANKRD20A1Q5TYW2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ANKRD20A1Q5TYW2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ANKRD20A1Q5TYW2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ANKRD20A1Q5TYW2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ANKRD20A1Q5TYW2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ANKRD20A1Q5TYW2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ANKRD20A1Q5TYW2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ANKRD20A1Q5TYW2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ANKRD20A1Q5TYW2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ANKRD20A1Q5TYW2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ANKRD20A1Q5TYW2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ANKRD20A1Q5TYW2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ANKRD20A1Q5TYW2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ANKRD20A1Q5TYW2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ANKRD20A1Q5TYW2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ANKRD20A1Q5TYW2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ANKRD20A1Q5TYW2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ANKRD20A1Q5TYW2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ANKRD20A1Q5TYW2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ANKRD20A1Q5TYW2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ANKRD20A1Q5TYW2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ANKRD20A1Q5TYW2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ANKRD20A1Q5TYW2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ANKRD20A1Q5TYW2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ANKRD20A1Q5TYW2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ANKRD20A1Q5TYW2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ANKRD20A1Q5TYW2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ANKRD20A1Q5TYW2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ANKRD20A1Q5TYW2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ANKRD20A1Q5TYW2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ANKRD20A1Q5TYW2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ANKRD20A1Q5TYW2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ANKRD20A1Q5TYW2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ANKRD20A1Q5TYW2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ANKRD20A1Q5TYW2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ANKRD20A1Q5TYW2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ANKRD20A1Q5TYW2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ANKRD20A1Q5TYW2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ANKRD20A1Q5TYW2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ANKRD20A1Q5TYW2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ANKRD20A1Q5TYW2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ANKRD20A1Q5TYW2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ANKRD20A1Q5TYW2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ANKRD20A1Q5TYW2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ANKRD20A1Q5TYW2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ANKRD20A1Q5TYW2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ANKRD20A1Q5TYW2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ANKRD20A1Q5TYW2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ANKRD20A1Q5TYW2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ANKRD20A1Q5TYW2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ANKRD20A1Q5TYW2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ANKRD20A1Q5TYW2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ANKRD20A1Q5TYW2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ANKRD20A1Q5TYW2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms