Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD3CQ5T2N8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATAD3CQ5T2N8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATAD3CQ5T2N8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATAD3CQ5T2N8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATAD3CQ5T2N8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATAD3CQ5T2N8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD3CQ5T2N8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD3CQ5T2N8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD3CQ5T2N8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD3CQ5T2N8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD3CQ5T2N8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD3CQ5T2N8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATAD3CQ5T2N8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATAD3CQ5T2N8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD3CQ5T2N8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD3CQ5T2N8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD3CQ5T2N8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD3CQ5T2N8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD3CQ5T2N8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD3CQ5T2N8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD3CQ5T2N8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD3CQ5T2N8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATAD3CQ5T2N8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATAD3CQ5T2N8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAD3CQ5T2N8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAD3CQ5T2N8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD3CQ5T2N8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD3CQ5T2N8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD3CQ5T2N8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAD3CQ5T2N8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD3CQ5T2N8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATAD3CQ5T2N8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAD3CQ5T2N8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATAD3CQ5T2N8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAD3CQ5T2N8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAD3CQ5T2N8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAD3CQ5T2N8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAD3CQ5T2N8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD3CQ5T2N8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD3CQ5T2N8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD3CQ5T2N8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATAD3CQ5T2N8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATAD3CQ5T2N8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATAD3CQ5T2N8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATAD3CQ5T2N8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATAD3CQ5T2N8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATAD3CQ5T2N8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATAD3CQ5T2N8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATAD3CQ5T2N8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATAD3CQ5T2N8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATAD3CQ5T2N8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATAD3CQ5T2N8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATAD3CQ5T2N8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATAD3CQ5T2N8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATAD3CQ5T2N8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATAD3CQ5T2N8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATAD3CQ5T2N8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.6 ms