Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAX1Q5SQQ9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAX1Q5SQQ9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAX1Q5SQQ9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAX1Q5SQQ9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAX1Q5SQQ9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAX1Q5SQQ9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAX1Q5SQQ9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAX1Q5SQQ9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAX1Q5SQQ9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAX1Q5SQQ9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAX1Q5SQQ9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAX1Q5SQQ9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAX1Q5SQQ9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAX1Q5SQQ9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAX1Q5SQQ9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAX1Q5SQQ9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAX1Q5SQQ9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAX1Q5SQQ9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAX1Q5SQQ9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAX1Q5SQQ9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAX1Q5SQQ9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VAX1Q5SQQ9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAX1Q5SQQ9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAX1Q5SQQ9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAX1Q5SQQ9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAX1Q5SQQ9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAX1Q5SQQ9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VAX1Q5SQQ9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAX1Q5SQQ9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAX1Q5SQQ9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAX1Q5SQQ9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VAX1Q5SQQ9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAX1Q5SQQ9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAX1Q5SQQ9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAX1Q5SQQ9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAX1Q5SQQ9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VAX1Q5SQQ9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VAX1Q5SQQ9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAX1Q5SQQ9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAX1Q5SQQ9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VAX1Q5SQQ9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VAX1Q5SQQ9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAX1Q5SQQ9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAX1Q5SQQ9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAX1Q5SQQ9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAX1Q5SQQ9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAX1Q5SQQ9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAX1Q5SQQ9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAX1Q5SQQ9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAX1Q5SQQ9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAX1Q5SQQ9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAX1Q5SQQ9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAX1Q5SQQ9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAX1Q5SQQ9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAX1Q5SQQ9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAX1Q5SQQ9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAX1Q5SQQ9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAX1Q5SQQ9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAX1Q5SQQ9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VAX1Q5SQQ9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAX1Q5SQQ9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAX1Q5SQQ9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAX1Q5SQQ9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAX1Q5SQQ9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAX1Q5SQQ9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAX1Q5SQQ9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAX1Q5SQQ9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAX1Q5SQQ9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAX1Q5SQQ9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAX1Q5SQQ9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAX1Q5SQQ9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAX1Q5SQQ9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAX1Q5SQQ9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAX1Q5SQQ9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAX1Q5SQQ9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAX1Q5SQQ9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAX1Q5SQQ9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAX1Q5SQQ9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAX1Q5SQQ9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAX1Q5SQQ9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAX1Q5SQQ9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAX1Q5SQQ9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAX1Q5SQQ9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAX1Q5SQQ9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAX1Q5SQQ9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAX1Q5SQQ9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAX1Q5SQQ9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAX1Q5SQQ9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAX1Q5SQQ9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAX1Q5SQQ9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAX1Q5SQQ9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAX1Q5SQQ9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAX1Q5SQQ9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAX1Q5SQQ9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAX1Q5SQQ9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAX1Q5SQQ9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAX1Q5SQQ9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAX1Q5SQQ9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAX1Q5SQQ9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms