Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39Q53RE8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39Q53RE8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39Q53RE8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39Q53RE8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD39Q53RE8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD39Q53RE8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD39Q53RE8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39Q53RE8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39Q53RE8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD39Q53RE8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD39Q53RE8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD39Q53RE8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD39Q53RE8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD39Q53RE8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD39Q53RE8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD39Q53RE8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39Q53RE8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD39Q53RE8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39Q53RE8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39Q53RE8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD39Q53RE8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39Q53RE8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39Q53RE8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39Q53RE8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD39Q53RE8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39Q53RE8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39Q53RE8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD39Q53RE8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD39Q53RE8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD39Q53RE8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD39Q53RE8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39Q53RE8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD39Q53RE8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39Q53RE8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39Q53RE8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39Q53RE8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD39Q53RE8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD39Q53RE8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39Q53RE8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39Q53RE8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD39Q53RE8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD39Q53RE8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD39Q53RE8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39Q53RE8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD39Q53RE8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD39Q53RE8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39Q53RE8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD39Q53RE8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD39Q53RE8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39Q53RE8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39Q53RE8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39Q53RE8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD39Q53RE8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD39Q53RE8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD39Q53RE8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD39Q53RE8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD39Q53RE8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ANKRD39Q53RE8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD39Q53RE8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD39Q53RE8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ANKRD39Q53RE8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD39Q53RE8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD39Q53RE8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD39Q53RE8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD39Q53RE8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD39Q53RE8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD39Q53RE8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD39Q53RE8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD39Q53RE8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD39Q53RE8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD39Q53RE8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ANKRD39Q53RE8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD39Q53RE8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD39Q53RE8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD39Q53RE8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ANKRD39Q53RE8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD39Q53RE8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ANKRD39Q53RE8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD39Q53RE8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ANKRD39Q53RE8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ANKRD39Q53RE8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD39Q53RE8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD39Q53RE8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD39Q53RE8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD39Q53RE8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ANKRD39Q53RE8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ANKRD39Q53RE8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ANKRD39Q53RE8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD39Q53RE8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD39Q53RE8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ANKRD39Q53RE8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ANKRD39Q53RE8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ANKRD39Q53RE8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ANKRD39Q53RE8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD39Q53RE8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ANKRD39Q53RE8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39Q53RE8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39Q53RE8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ANKRD39Q53RE8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms