Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LACTB2Q53H82 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LACTB2Q53H82 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LACTB2Q53H82 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LACTB2Q53H82 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LACTB2Q53H82 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LACTB2Q53H82 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LACTB2Q53H82 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LACTB2Q53H82 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LACTB2Q53H82 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LACTB2Q53H82 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LACTB2Q53H82 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LACTB2Q53H82 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LACTB2Q53H82 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LACTB2Q53H82 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LACTB2Q53H82 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LACTB2Q53H82 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LACTB2Q53H82 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LACTB2Q53H82 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LACTB2Q53H82 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LACTB2Q53H82 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LACTB2Q53H82 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LACTB2Q53H82 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
LACTB2Q53H82 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LACTB2Q53H82 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LACTB2Q53H82 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LACTB2Q53H82 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LACTB2Q53H82 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LACTB2Q53H82 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LACTB2Q53H82 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LACTB2Q53H82 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LACTB2Q53H82 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LACTB2Q53H82 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LACTB2Q53H82 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LACTB2Q53H82 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LACTB2Q53H82 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LACTB2Q53H82 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LACTB2Q53H82 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LACTB2Q53H82 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LACTB2Q53H82 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LACTB2Q53H82 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LACTB2Q53H82 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LACTB2Q53H82 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LACTB2Q53H82 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LACTB2Q53H82 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LACTB2Q53H82 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LACTB2Q53H82 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LACTB2Q53H82 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LACTB2Q53H82 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LACTB2Q53H82 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LACTB2Q53H82 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LACTB2Q53H82 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LACTB2Q53H82 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LACTB2Q53H82 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LACTB2Q53H82 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LACTB2Q53H82 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LACTB2Q53H82 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LACTB2Q53H82 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LACTB2Q53H82 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LACTB2Q53H82 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LACTB2Q53H82 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
LACTB2Q53H82 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LACTB2Q53H82 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LACTB2Q53H82 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LACTB2Q53H82 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LACTB2Q53H82 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LACTB2Q53H82 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LACTB2Q53H82 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LACTB2Q53H82 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LACTB2Q53H82 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LACTB2Q53H82 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LACTB2Q53H82 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LACTB2Q53H82 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LACTB2Q53H82 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LACTB2Q53H82 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LACTB2Q53H82 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LACTB2Q53H82 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LACTB2Q53H82 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LACTB2Q53H82 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LACTB2Q53H82 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LACTB2Q53H82 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LACTB2Q53H82 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LACTB2Q53H82 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LACTB2Q53H82 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LACTB2Q53H82 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LACTB2Q53H82 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LACTB2Q53H82 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LACTB2Q53H82 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LACTB2Q53H82 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LACTB2Q53H82 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LACTB2Q53H82 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LACTB2Q53H82 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LACTB2Q53H82 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LACTB2Q53H82 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LACTB2Q53H82 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LACTB2Q53H82 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LACTB2Q53H82 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LACTB2Q53H82 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LACTB2Q53H82 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LACTB2Q53H82 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms