Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIN52Q52LA3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LIN52Q52LA3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LIN52Q52LA3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LIN52Q52LA3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LIN52Q52LA3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LIN52Q52LA3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LIN52Q52LA3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LIN52Q52LA3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LIN52Q52LA3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LIN52Q52LA3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LIN52Q52LA3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LIN52Q52LA3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LIN52Q52LA3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LIN52Q52LA3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LIN52Q52LA3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LIN52Q52LA3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LIN52Q52LA3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LIN52Q52LA3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LIN52Q52LA3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LIN52Q52LA3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LIN52Q52LA3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LIN52Q52LA3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LIN52Q52LA3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LIN52Q52LA3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LIN52Q52LA3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LIN52Q52LA3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LIN52Q52LA3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LIN52Q52LA3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LIN52Q52LA3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LIN52Q52LA3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LIN52Q52LA3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LIN52Q52LA3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LIN52Q52LA3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LIN52Q52LA3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LIN52Q52LA3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LIN52Q52LA3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LIN52Q52LA3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LIN52Q52LA3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LIN52Q52LA3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LIN52Q52LA3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LIN52Q52LA3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LIN52Q52LA3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LIN52Q52LA3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LIN52Q52LA3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LIN52Q52LA3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LIN52Q52LA3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LIN52Q52LA3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LIN52Q52LA3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LIN52Q52LA3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LIN52Q52LA3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LIN52Q52LA3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LIN52Q52LA3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LIN52Q52LA3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LIN52Q52LA3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LIN52Q52LA3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LIN52Q52LA3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LIN52Q52LA3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LIN52Q52LA3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LIN52Q52LA3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LIN52Q52LA3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIN52Q52LA3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIN52Q52LA3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIN52Q52LA3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIN52Q52LA3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIN52Q52LA3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIN52Q52LA3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIN52Q52LA3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIN52Q52LA3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIN52Q52LA3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIN52Q52LA3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIN52Q52LA3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIN52Q52LA3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LIN52Q52LA3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LIN52Q52LA3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LIN52Q52LA3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LIN52Q52LA3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIN52Q52LA3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIN52Q52LA3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIN52Q52LA3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIN52Q52LA3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIN52Q52LA3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIN52Q52LA3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIN52Q52LA3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIN52Q52LA3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIN52Q52LA3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIN52Q52LA3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LIN52Q52LA3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIN52Q52LA3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIN52Q52LA3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIN52Q52LA3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIN52Q52LA3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIN52Q52LA3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIN52Q52LA3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIN52Q52LA3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIN52Q52LA3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIN52Q52LA3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIN52Q52LA3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIN52Q52LA3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIN52Q52LA3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms