Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYTL3Q4VX76 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYTL3Q4VX76 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYTL3Q4VX76 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYTL3Q4VX76 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYTL3Q4VX76 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYTL3Q4VX76 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYTL3Q4VX76 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYTL3Q4VX76 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYTL3Q4VX76 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYTL3Q4VX76 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYTL3Q4VX76 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYTL3Q4VX76 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYTL3Q4VX76 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYTL3Q4VX76 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYTL3Q4VX76 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYTL3Q4VX76 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYTL3Q4VX76 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYTL3Q4VX76 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYTL3Q4VX76 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYTL3Q4VX76 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYTL3Q4VX76 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYTL3Q4VX76 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYTL3Q4VX76 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYTL3Q4VX76 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYTL3Q4VX76 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYTL3Q4VX76 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYTL3Q4VX76 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYTL3Q4VX76 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYTL3Q4VX76 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYTL3Q4VX76 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYTL3Q4VX76 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYTL3Q4VX76 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYTL3Q4VX76 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SYTL3Q4VX76 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYTL3Q4VX76 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYTL3Q4VX76 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYTL3Q4VX76 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYTL3Q4VX76 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYTL3Q4VX76 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYTL3Q4VX76 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYTL3Q4VX76 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SYTL3Q4VX76 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYTL3Q4VX76 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYTL3Q4VX76 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYTL3Q4VX76 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYTL3Q4VX76 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYTL3Q4VX76 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYTL3Q4VX76 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYTL3Q4VX76 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYTL3Q4VX76 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYTL3Q4VX76 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYTL3Q4VX76 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYTL3Q4VX76 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYTL3Q4VX76 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SYTL3Q4VX76 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYTL3Q4VX76 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYTL3Q4VX76 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYTL3Q4VX76 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYTL3Q4VX76 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYTL3Q4VX76 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SYTL3Q4VX76 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYTL3Q4VX76 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYTL3Q4VX76 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYTL3Q4VX76 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYTL3Q4VX76 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYTL3Q4VX76 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYTL3Q4VX76 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYTL3Q4VX76 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYTL3Q4VX76 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYTL3Q4VX76 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SYTL3Q4VX76 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYTL3Q4VX76 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYTL3Q4VX76 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYTL3Q4VX76 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYTL3Q4VX76 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYTL3Q4VX76 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYTL3Q4VX76 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYTL3Q4VX76 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYTL3Q4VX76 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYTL3Q4VX76 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYTL3Q4VX76 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYTL3Q4VX76 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYTL3Q4VX76 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYTL3Q4VX76 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYTL3Q4VX76 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYTL3Q4VX76 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYTL3Q4VX76 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYTL3Q4VX76 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYTL3Q4VX76 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYTL3Q4VX76 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYTL3Q4VX76 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SYTL3Q4VX76 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYTL3Q4VX76 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYTL3Q4VX76 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYTL3Q4VX76 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYTL3Q4VX76 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYTL3Q4VX76 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYTL3Q4VX76 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYTL3Q4VX76 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms