Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SYTL3Q4VX76 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYTL3Q4VX76 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
SYTL3Q4VX76 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SYTL3Q4VX76 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYTL3Q4VX76 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYTL3Q4VX76 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SYTL3Q4VX76 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYTL3Q4VX76 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SYTL3Q4VX76 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SYTL3Q4VX76 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SYTL3Q4VX76 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SYTL3Q4VX76 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SYTL3Q4VX76 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SYTL3Q4VX76 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SYTL3Q4VX76 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SYTL3Q4VX76 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYTL3Q4VX76 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYTL3Q4VX76 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYTL3Q4VX76 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYTL3Q4VX76 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYTL3Q4VX76 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYTL3Q4VX76 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYTL3Q4VX76 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYTL3Q4VX76 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYTL3Q4VX76 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYTL3Q4VX76 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYTL3Q4VX76 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYTL3Q4VX76 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYTL3Q4VX76 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYTL3Q4VX76 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYTL3Q4VX76 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYTL3Q4VX76 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SYTL3Q4VX76 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYTL3Q4VX76 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYTL3Q4VX76 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYTL3Q4VX76 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYTL3Q4VX76 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYTL3Q4VX76 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYTL3Q4VX76 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYTL3Q4VX76 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYTL3Q4VX76 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYTL3Q4VX76 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYTL3Q4VX76 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYTL3Q4VX76 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYTL3Q4VX76 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYTL3Q4VX76 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYTL3Q4VX76 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYTL3Q4VX76 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYTL3Q4VX76 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYTL3Q4VX76 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYTL3Q4VX76 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYTL3Q4VX76 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYTL3Q4VX76 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYTL3Q4VX76 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYTL3Q4VX76 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SYTL3Q4VX76 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYTL3Q4VX76 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYTL3Q4VX76 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYTL3Q4VX76 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYTL3Q4VX76 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYTL3Q4VX76 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYTL3Q4VX76 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYTL3Q4VX76 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYTL3Q4VX76 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYTL3Q4VX76 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYTL3Q4VX76 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYTL3Q4VX76 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYTL3Q4VX76 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYTL3Q4VX76 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYTL3Q4VX76 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYTL3Q4VX76 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYTL3Q4VX76 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYTL3Q4VX76 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SYTL3Q4VX76 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYTL3Q4VX76 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SYTL3Q4VX76 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYTL3Q4VX76 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYTL3Q4VX76 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYTL3Q4VX76 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYTL3Q4VX76 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYTL3Q4VX76 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYTL3Q4VX76 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYTL3Q4VX76 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SYTL3Q4VX76 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYTL3Q4VX76 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYTL3Q4VX76 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYTL3Q4VX76 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYTL3Q4VX76 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYTL3Q4VX76 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYTL3Q4VX76 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYTL3Q4VX76 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SYTL3Q4VX76 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYTL3Q4VX76 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYTL3Q4VX76 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYTL3Q4VX76 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYTL3Q4VX76 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYTL3Q4VX76 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYTL3Q4VX76 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYTL3Q4VX76 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms