Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RAB3GAP1Q15042 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RAB3GAP1Q15042 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RAB3GAP1Q15042 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAB3GAP1Q15042 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RAB3GAP1Q15042 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAB3GAP1Q15042 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RAB3GAP1Q15042 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
RAB3GAP1Q15042 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RAB3GAP1Q15042 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
RAB3GAP1Q15042 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAB3GAP1Q15042 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAB3GAP1Q15042 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAB3GAP1Q15042 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RAB3GAP1Q15042 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RAB3GAP1Q15042 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RAB3GAP1Q15042 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAB3GAP1Q15042 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAB3GAP1Q15042 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RAB3GAP1Q15042 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RAB3GAP1Q15042 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RAB3GAP1Q15042 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RAB3GAP1Q15042 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RAB3GAP1Q15042 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RAB3GAP1Q15042 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RAB3GAP1Q15042 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RAB3GAP1Q15042 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RAB3GAP1Q15042 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RAB3GAP1Q15042 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RAB3GAP1Q15042 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RAB3GAP1Q15042 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RAB3GAP1Q15042 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RAB3GAP1Q15042 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RAB3GAP1Q15042 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RAB3GAP1Q15042 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RAB3GAP1Q15042 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RAB3GAP1Q15042 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RAB3GAP1Q15042 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RAB3GAP1Q15042 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RAB3GAP1Q15042 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RAB3GAP1Q15042 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RAB3GAP1Q15042 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RAB3GAP1Q15042 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
RAB3GAP1Q15042 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RAB3GAP1Q15042 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAB3GAP1Q15042 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAB3GAP1Q15042 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAB3GAP1Q15042 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAB3GAP1Q15042 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RAB3GAP1Q15042 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RAB3GAP1Q15042 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAB3GAP1Q15042 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAB3GAP1Q15042 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAB3GAP1Q15042 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RAB3GAP1Q15042 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAB3GAP1Q15042 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAB3GAP1Q15042 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RAB3GAP1Q15042 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RAB3GAP1Q15042 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAB3GAP1Q15042 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RAB3GAP1Q15042 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RAB3GAP1Q15042 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RAB3GAP1Q15042 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RAB3GAP1Q15042 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAB3GAP1Q15042 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAB3GAP1Q15042 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAB3GAP1Q15042 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RAB3GAP1Q15042 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
RAB3GAP1Q15042 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RAB3GAP1Q15042 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RAB3GAP1Q15042 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RAB3GAP1Q15042 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RAB3GAP1Q15042 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RAB3GAP1Q15042 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RAB3GAP1Q15042 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RAB3GAP1Q15042 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RAB3GAP1Q15042 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
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