Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.65■■■■■ 4.1
RAB3GAP1Q15042 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
RAB3GAP1Q15042 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
RAB3GAP1Q15042 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
RAB3GAP1Q15042 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
RAB3GAP1Q15042 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
RAB3GAP1Q15042 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
RAB3GAP1Q15042 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
RAB3GAP1Q15042 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
RAB3GAP1Q15042 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
RAB3GAP1Q15042 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
RAB3GAP1Q15042 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
RAB3GAP1Q15042 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
RAB3GAP1Q15042 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
RAB3GAP1Q15042 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
RAB3GAP1Q15042 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
RAB3GAP1Q15042 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RAB3GAP1Q15042 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RAB3GAP1Q15042 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
RAB3GAP1Q15042 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RAB3GAP1Q15042 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
RAB3GAP1Q15042 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RAB3GAP1Q15042 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RAB3GAP1Q15042 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
RAB3GAP1Q15042 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
RAB3GAP1Q15042 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RAB3GAP1Q15042 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RAB3GAP1Q15042 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
RAB3GAP1Q15042 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RAB3GAP1Q15042 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
RAB3GAP1Q15042 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
RAB3GAP1Q15042 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
RAB3GAP1Q15042 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RAB3GAP1Q15042 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RAB3GAP1Q15042 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RAB3GAP1Q15042 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
RAB3GAP1Q15042 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
RAB3GAP1Q15042 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
RAB3GAP1Q15042 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RAB3GAP1Q15042 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RAB3GAP1Q15042 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RAB3GAP1Q15042 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RAB3GAP1Q15042 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RAB3GAP1Q15042 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RAB3GAP1Q15042 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAB3GAP1Q15042 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
RAB3GAP1Q15042 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RAB3GAP1Q15042 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RAB3GAP1Q15042 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
RAB3GAP1Q15042 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RAB3GAP1Q15042 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RAB3GAP1Q15042 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAB3GAP1Q15042 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
RAB3GAP1Q15042 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAB3GAP1Q15042 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAB3GAP1Q15042 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAB3GAP1Q15042 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RAB3GAP1Q15042 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
RAB3GAP1Q15042 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
RAB3GAP1Q15042 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAB3GAP1Q15042 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAB3GAP1Q15042 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
RAB3GAP1Q15042 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RAB3GAP1Q15042 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
RAB3GAP1Q15042 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RAB3GAP1Q15042 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
RAB3GAP1Q15042 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RAB3GAP1Q15042 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RAB3GAP1Q15042 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RAB3GAP1Q15042 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RAB3GAP1Q15042 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RAB3GAP1Q15042 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RAB3GAP1Q15042 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RAB3GAP1Q15042 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RAB3GAP1Q15042 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RAB3GAP1Q15042 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
RAB3GAP1Q15042 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RAB3GAP1Q15042 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RAB3GAP1Q15042 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RAB3GAP1Q15042 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RAB3GAP1Q15042 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
RAB3GAP1Q15042 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RAB3GAP1Q15042 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
RAB3GAP1Q15042 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RAB3GAP1Q15042 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RAB3GAP1Q15042 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RAB3GAP1Q15042 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RAB3GAP1Q15042 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RAB3GAP1Q15042 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
RAB3GAP1Q15042 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RAB3GAP1Q15042 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
RAB3GAP1Q15042 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RAB3GAP1Q15042 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RAB3GAP1Q15042 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RAB3GAP1Q15042 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
RAB3GAP1Q15042 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
RAB3GAP1Q15042 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RAB3GAP1Q15042 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RAB3GAP1Q15042 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RAB3GAP1Q15042 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
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